通常情况下，怀孕期间可以做亲子鉴定，一般在孕4-8个月比较适合做。
具体来说，亲子鉴定主要有两个方面：羊水亲子鉴定绒毛膜亲子鉴定。
1.羊水亲子鉴定：首先要做的是，抽取羊水，从羊水中抽取脱落细胞，用试剂提取DNA物质，然后与男子的DNA进行比对。
2.绒毛亲子鉴定：一般在怀孕八周后进行，需要提供母亲的样本进行绒毛检测，然后提取样本细胞核中所含的DNA，再进分析。担忧已孕初期胚胎发育不成熟，绒毛穿刺易引发流产，一定要在正规医院，由专业医生进行检查。
脑瘫在怀孕时是不能查出的。在怀孕期间能够做唐氏筛查和四维检查，能够排除胎儿先天性基因方面的问题和发育异常的问题。如果在怀孕期间有脑积水，容易导致脑瘫的几率比较高。
怀孕四个月就可以进行亲子鉴定了。
在孕妇怀孕三个月以后，羊膜腔内的羊水就会逐渐形成，四个月时月时羊水基本充足，这个时候就可以进行羊膜腔穿刺，通过抽取羊水进行DNA鉴定。最好是在四个月后才进行羊膜腔穿刺，因为过早的话，羊腔膜内羊水比较少，所以穿刺起来会比较困难，而且也有可能会对胎儿造成伤害。所以一般建议最少在四个月以后进行。
怀孕期间是可以做亲子鉴定的，在最早期时，可在怀孕的2个月左右，用特定仪器取绒毛这时就可做DNA鉴定，也可在怀孕4个月左右抽取羊水，然后做胎儿DNA鉴定，这两种检查方法都比较准确，能够达到99.9%以上。
孕期查不出孩子是否患有脑瘫，在怀孕期间，通过四维B超检查可以发现胎儿有肢体或者脑的结构发育的异常，但这只能作为一个胎儿可能会患脑瘫的高危因素，不能以此为据确诊胎儿一定会患脑瘫。
怀孕四个月羊水充足，这时候可以通过羊膜腔穿刺，抽取羊水做DNA鉴定，也就是常说的亲子鉴定。如果时间更早，因为羊水比较少，穿刺起来有些困难，也有可能会损伤到胎儿。怀孕时间更晚，羊水量充足，可以在超声波定位下穿刺抽取，操作起来比较简单，也不会影响到胎儿。
