肝内胆管结石不会自愈。如果患者有手术指征及早进行手术治疗。采取的手术方式是高位胆管切开取石术。如果患者肝内胆管结石造成某一叶的肝脏萎缩，可以行肝部分切除或者肝段切除。
肝内胆管结石体积相对较大且超过2-3厘米，要尽快的做手术。如果体积小于一厘米，可以先做一些简单的处理，可以服用一些能促进胆囊功能、排石和保肝的药物进行治疗，并且要定期复查。肝内胆管结石是难以通过微创手术治疗的。内窥镜和导丝不允许进入更深的石头位置。要继续口服药物，并每三个月进行一次审查。如果结石增加明显，应该考虑手术治疗。平时注意休息，饮食清淡，避免刺激性饮食，注意卫生，避免感染的出现，同时避免过度的劳累。
通常情况下，引起肝内胆管结石的常见原因有胆汁的排泌障碍、细菌感染、寄生虫感染、先天的胆管扩张症等。
胆管结石是临床胆石症的一种，临床上最常见的症状是上腹部疼痛，可呈胀痛或是绞痛，部分患者伴有发热。肝管梗阻时，可出的黄疸，通常来说，引起肝内胆管结石的常见原因有胆汁的排泌障碍、细菌感染、寄生虫感染、先天的胆管扩张症等。
肝内胆管结石伴有胆管炎症的，饮食上需要更加注意。对于辛辣刺激食物也不能吃太多，如辣椒，大蒜，生姜，韭菜，芥末，尖椒等。这些食物可导致刺激胃粘膜，引起消化不良以及十二指肠乳头水肿，导致胆汁反流以及引流不畅，最终会引起胆管结石炎症反复发作。
可以通过药物刺激，分泌出的胆汁使胆囊口自动打开，胆管自动放大，胆囊收缩时，通过药物刺激变松弛的胆管排出，然后进入肠道，在肠道的蠕动下最终以排便的形式排出体外。
之前就是比较喜欢喝酒的，还是要控制好自己的饮食的，而慢性期并发症包括全身营养不良、贫血、低蛋白血症，慢性胆管炎和胆源性肝脓肿，多发性肝胆管狭窄、肝叶纤维化萎缩、胆汁性肝硬化、门脉高压症、肝功能失代偿及长期胆道感染、胆汁滞留有关的迟发性肝胆管癌。
