巧克力囊肿腹腔镜手术最佳时间并没有明确要求，需要根据患者的情况来分析。
巧克力囊肿的手术时机并不是很确定，要根据患者的具体病情来决定。卵巢巧克力囊肿最好避开经期进行手术当然，女性在月经结束后3-7日是手术比较好的时间。女性月经来潮后3-7日需要进行输卵管和子宫的检查。如果伴有卵巢朱古氏囊肿，需要进行子宫内窥镜下的子宫不育和双侧输卵管畅通的检测。
如果囊肿不是很大，没有什么临床症状的情况下，先不要手术，应该先复查看一下情况怎么样。如果临床症状比较严重，一般是需要进行手术切除的，手术以后一般是可以有很好的治疗效果的。
囊肿都是一个良性的疾病，一般不需要特殊的治疗，定期复查就可以了，超过五厘米的情况下，才建议手术治疗，手术可以采用微创手术，微创手术的治疗效果好，创伤小，恢复快等优点。
通常情况下，做卵巢囊肿检查的最佳时间是月经干净3-7天。具体情况分析如下：
卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，患者可能会出现坠胀、下腹部不适、月经异常等症状，月经干净3-7天的患者此时去做卵巢囊肿检查，由于阴道分泌物少，盆腔也不会处于充血状态，会更清晰的了解到卵巢囊肿的大小，初步判断卵巢囊肿的性质。患者可以按照医嘱使用消结安胶囊、红金消结浓缩丸、桂枝茯苓胶囊等药进行治疗。
宝宝出生时，发现有鳃裂囊肿，现在宝宝已经有20个月，如手术治疗，时间选择在宝宝2-3岁左右，手术效果比较好。同时要注意防寒保暖，预防感冒，保持口腔卫生，多带宝宝到户外晒太阳，增强体质，定期复查。
对于卵巢囊肿的治疗，通常是需要考虑手术的，具体的治疗时间，在月经干净后三到七天做较好，这样是不会影响到以后正常的月经的，也不会因此造成月经异常，对于身体的恢复是较好的，这一点是不能忽视的，手术时间不当，对于身体恢复是不利的，这一点一定要慎重，术前检查工作也是需要做好的。
