自然周期移植有优点也有缺点。自然周期移植是指在进行试管婴儿的时候，不使用药物来促使女性的卵泡发育和排卵，等正常的月经周期排卵的发生，在去卵子进行受精培养。
自然周期移植的好处是让自身的调节力参与进来，因为有自身激素的调节，所以用药量少，副作用就会少，但是移植条件比较来说就会相当苛刻。如果月经规律可以正常排卵，内膜厚度适中，体温明显双向，排卵试纸测到强阳，那么就可以试试自然周期移植。
如果女性平时月经周期比较规律，那么进行胚胎移植当然是自然周期要比人工周期好。自然周期会相对安全一些，同时也不会对人体产生不利的影响。人工周期是需要用药调节的。在做胚胎移植以前，患者要解除一切心理压力，而且要保持愉快的心情，保证良好的睡眠。移植以后一定要注意休息，避免重体力劳动，而且要定期到去做检查。
试管婴儿是用超促排卵方案，获取多枚卵子，在体外受精形成胚胎，没有特殊状况，内膜厚8-12毫米，可以选择新鲜移植。不适合新鲜移植，可以把胚胎冷冻，冻胚移植。新鲜移植失败后，可以休息2-3个月后，有胚胎，可以选择冻胚移植。没有胚胎可以重新进周期取卵。冻胚移植失败后，有胚胎可以下次月经后，准备内膜，移植。
做试管婴儿的自然周期是指自己排卵长内膜等卵子排掉之后移植，人工周期就是靠吃药长内膜等内膜长够了移植。一般是自然周期好，获得的卵子自然发育成熟，子宫内膜环境也比较好，这样更有利于胚胎种植发育。
人工周期超排卵得到的胚胎数量多，质量好，但不能一次全部移植，为了提高移植成功率往往要采用冷冻胚胎保存。人工周期移植冻胎的程序首先要通过试管培育技术得到多个质量好的胚胎，内膜达到196可以移植。
