引起胚胎停育的原因太多了，染色体发育异常是造成胚胎停育的最大元凶，而造成染色体异常的原因有辐射、药物、食物激素等影响，或者使用了不合格的护肤品、指甲油等，因为这些产品可能会含有甲醛等致畸物质。
胚胎停止发育可能跟男性精子质量差有关系，常见原因有染色体异常、免疫功能不全、内分泌功能紊乱、子宫内环境异常、遗传性血栓形成倾向、全身感染性疾病等女性危险因素、精子成熟障碍等男性危险因素、环境不良等因素。
生殖道解剖结构异常，内分泌异常，生殖道感染，血栓性疾病因素，免疫因素，其他尚有男性因素，都是导致胎停出现的原因。现在需要检查明确导致胎停的原因，针对性调理确保下次安全孕育。
胚胎停育的原因包括：一、遗传因素。如果本身存在先天性遗传基因缺陷、染色体异常等问题时，就会增大发生胚胎停育的几率，常见的遗传基因缺陷主要是精子染色体异常或者卵子染色体异常。二、激素分泌不足。激素分泌不足也是一个导致胚胎停育的主要因素，激素分泌不足就会导致胚胎发育受到影响而造成停胎。三、子宫腔畸形。
生殖内分泌方面因为胚胎早期发育的时候需要三个重要的激素水平一个是雌激素一个是孕激素一个是绒毛膜促性腺激素如果母体自身的内源性激素不够就会造成胚胎的停育。
造成胚胎停止发育的原因有很多，比如遗传因素、感染免疫因素、接触放射性的物质和有毒的化学制剂、药物，生活环境等。也有部分的胚胎停止发育往往找不到明显的原因，孕早期的胎停育多与孕激素的不足有关，女性一旦出现胚胎停止发育的现象，不要急于再次怀孕，建议男女双方一同到正规的医院做系统的检查，比如优生优育、精子质量、卵子发育情况、体内激素水平的测定等。
