先天性巨结肠手术后大便次数增多或失禁或胀气，说明手术创面没有完全恢复正常，肠功能比较紊乱，肠道还有炎症存在，口服消炎药，严重的情况可以进的抗生素治疗，局部热敷或者烤电，尽量多喝流质和热粥，不要吃太硬太干太凉的食物，不要吃的太饱，做到少吃多餐比较好。
术后拉肚子很可能是因为手术期间精神过度紧张或着凉导致的。
患者首先要注意保暖、心情舒畅、勿过度紧张。若腹泻症状不是特别严重，可饮用益生菌进行治疗，益生菌可调理肠道正常菌群，减轻腹泻，若腹泻次数较多者可服用蒙脱石散以起到涩肠、止泻之效。患者日常也要注意饮食健康，避免吃辛辣刺激性食物，加重拉肚子的症状。
婴儿巨结肠手术后初步的恢复要一周时间，但完全恢复可能要半年以上，术后需要一段时间的禁食水至排气，一定给他吃一些比较清淡的饮食，然后主要是进食流质饮食，尤其的饮食要避免辛辣食物。
巨结肠手术治疗的后遗症和并发症较为常见的为肠梗阻，排便功能障碍，肠瘘，吻合口狭窄等。并且后遗症的概率是随着年龄的增大而变大，因此在发现巨结肠后要及时的进行手术治疗。
一般情况下，手术后拉肚子可以采取药物治疗、日常护理等方式进行治疗，缓解相关症状。具体内容如下：
1.药物治疗：手术后拉肚子，患者可以及时前往正规医院，在医生指导下使用黄连素和双歧杆菌进行治疗。
2.日常护理：患者要注意休息，不要过度运动和疲劳，要调整饮食，尽量少食多餐，避免胃肠蓄积的食物过多，增加肠道负担，加重消化不良，从而出现拉肚子的情况。
巨结肠术后护理为术后2-3天肠道功能恢复，肛门排便排气，开始进食，开始要少食多餐，每次为正常量的三分之一，尽量与术前饮食一致。术后早期由于肛门功能未恢复，排便次数较多，每天甚至可达几十次，因此术后特别强调肛周皮肤的清洁消毒和保持干燥，每次排便后要用生理盐水，或温水洗干净并擦干。
