胆固醇结晶不需要特别治疗。如果患者症状不明显，并且没有明显的诱因，只需定期复查，观察胆固醇结晶的进展即可。可以口服一些药物治疗，如果状缓解不明显，则需要结合胃镜，了解其它脏器的病变，有些胆固醇结晶，随着病情的发展，会演变成明显的胆囊结石，症状明显则需要手术治疗。
胆结石的治疗首先是要根据病人的临床表现以及结石的大小决定治疗方案，如果结石较大有引起梗阻，或者是黄疸可能需要通过手术治疗，否则，一般都是选择对症处理的药物，具体药物的用法用量要在临床医生的指导下应用。
胆固醇结晶如果比较小，没有明显的症状，暂时不需手术，三到六个月进行复查一次，依据复查的结果再确定治疗方案。如果胆固醇结晶比较大，在胆囊有较大的结石能引起症状需要尽快的做手术。
维生素是维持尿道内膜健康所必要的物质，也有助于阻碍结石复发。富含维生素的食物有绿花椰菜、杏果、香瓜、南瓜、牛肝等。少吃含钙高的食物。限量摄入糖类，高糖食品的摄入，可以使患肾结石的机会增加，因此，要注意少吃甜食。
可以先在消化内科医生的指导下，口服一些消炎利胆的药物控制病情进展。平时要保持良好的情绪。低胆固醇饮食，三餐要有规律，避免暴饮暴食。戒烟限酒。尽量都吃一些低脂类的食物，少吃油腻、油炸食品，每天进行锻炼。
肾萎缩，那么应该可能是慢性的炎症引起的，可考虑中西结合治疗，中药以补肾为主，西药帮助消炎。二个方面同时治疗可能效果会更好，同时定时间做相应的检查，中药用药请有经验的中医内科老的医生开方，西药配合消炎可能会更好。
