通常情况下，怀孕时发现右侧卵巢囊肿，囊肿比较大时需要进行治疗。具体情况分析如下：
卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，患者可能会出现坠胀、下腹部不适、月经异常等症状，如果囊肿比较大，可能会压迫子宫而影响胎儿的发育，或者在胎儿发育过程中可能会发生卵巢囊肿的破裂，因此怀孕时发现右侧卵巢囊肿，囊肿比较大时需要进行治疗。
囊肿的生成多数是生理性的，不会有什么影响，只要减少劳累，注意休息，囊肿大多数可以自己吸收掉的。如果囊肿没有影响到卵巢的功能，只要还有卵泡形成，怀孕还是有可能的。
卵巢囊肿即使是良性的，也有可能随着子宫的增大产生不良影响。卵巢囊肿在早孕时可能引起流产，中期妊娠时则易发生卵巢囊肿蒂扭转，晚期妊娠囊肿较大者可导致胎位异常，分娩时可能阻塞产道引起难产。妊娠期盆腔充血，可使肿瘤迅速增大甚至有引起恶变的可能，所以在不影响妊娠的情况下，应尽早做手术。
卵巢囊肿大多数是不容易怀孕的，就是怀孕了也容易引起畸胎瘤。卵巢囊肿导致女性不孕。卵巢是卵子发育、成熟、排出的场所，而各个不同阶段的卵泡在卵巢皮质，若卵巢遭受到破坏，使卵子发育、成熟及排出受损，就会导致不孕。在怀孕之前一定要先治疗。
卵巢囊肿是妇科系统常见的良性肿瘤之一，如果没有明显的不适症状，通常不会对身体造成影响，可以不做处理，定期观察，有部分囊肿可以被自行吸收。较大的囊肿可以通过手术或介入来治疗。
卵巢囊肿有生理性和病理性两种，生理性卵巢囊肿会随着月经来潮而萎缩，病理性的卵巢囊肿与炎症刺激、内分泌失调有关。单侧囊肿，一侧也能排卵，可以受孕。如果两侧都有囊肿，而且体积在5cm以上，就会影响到怀孕。
这是因为卵巢囊肿会影响到卵巢的正常功能，从而引起内分泌紊乱，或者是囊肿会阻碍卵泡的发育和成熟，从而影响到黄体的功能，从而影响到受孕。达到5cm是必须要做手术的，否则可能会出现撕裂和扭曲。
