治疗的目标为解剖症状和控制心律失常。当出现左心室偏心性肥厚、左心室功能受损时，应当注意心力衰竭的发生，此时应进行抗心力衰竭的治疗。梗阻性心肌病考虑手术治疗，作室间隔肌纵深切开术和肥厚心肌部分切除术以缓解症状。近年来试用双腔永久起搏器作右心室房室顺序起搏，以缓解梗阻型的症状。
心肌肥厚是可以痊愈的。
心肌肥厚可能是由于慢性高血压导致的左室和室壁肥大，或是由于肥胖导致的左室心肌不均匀性肥大等导致的。对于高血压性心肌病，采用ACEI或ARB等药物，可以有效地抑制血压，防止心脏扩张，从而可以治疗心肌肥厚。肥大性心肌病变可以采用酒精溶解或外科手术治疗，从而达到治疗心肌肥厚的目的。
主要是取决于原发疾病的严重程度以及是否规范治疗。高血压导致的心肌肥厚，主要发生在长期压力负荷过重的情况下，心肌总量增加，收缩力加强，使心脏得以维持正常的血循环，最后会导致心肌收缩力的减退，如果能积极控制血压，预期寿命和正常人无异。
心肌肥厚可以治疗。心肌肥厚常见于长期高血压引起的左心室和室间隔肥厚，或者是肥厚型心肌病引起的左室心肌非对称性肥厚这两种情况。高血压引起的心肌肥厚，通过积极控制血压治疗，应用特殊的药物可以逆转肥厚的心肌，避免心腔扩大。
高血压心肌肥厚可以手术治疗。高血压引起心肌肥厚，是由于病人的血压高，导致心脏的负重过大，引起了心肌代偿性肥厚增大，所以治疗上需要积极的控制高血压，血压控制好了，心肌肥厚的情况也会缓解。心肌肥厚就是高血压的并发症，然后再通过手术的方式治疗，这样可以更好的去明确一下的。
可逆转心肌肥厚的药物也就是改善心肌重构的药物，主要有β受体阻滞剂、血管紧张素转换酶抑制剂、钙离子拮抗剂等。
1.β受体阻滞剂：临床上常用的有美托洛尔片、比索洛尔片等，美托洛尔片又可以分为缓释片和平片，缓释片效果要更好。
2.血管紧张素转换酶抑制剂：如贝那普利，卡托普利，赖诺普利等。
3.钙离子拮抗剂：钙离子拮抗剂中的一部分药物也有此作用，临床上常用的有非洛地平片、硝苯地平片、拉西地平片等。
