本来是应该只存在于子宫内，子宫内膜具有根据体内激素水平的变化周期性增殖、脱落而形成月经。子宫内膜出现在别的地方。出现在其他地方的子宫内膜也和处于子宫内的子宫内膜一样，具有周期性增殖、脱落的规律。
巧克力囊肿的症状常见的有痛经、下腹痛、经期发热等多种，作为子宫内膜异位症的一种，巧克力囊肿除了含有子宫内膜异位症的症状外，还具有自己特定的症状。子宫侧后方可触及活动差的包块，提示合并有卵巢巧克力囊肿，应引起注意。
可采用药物或（和）手术治疗。除手术外，尚无一种理想的治疗方法。无论是药物治疗抑或保守性乎术均有相当高的复发率。主张选对药物积极治疗并结合密切随访复查，注意卵巢囊肿的性质变化，再采取相应的对策。
如果是想检查一下是否有巧克力囊肿，只要做一个妇科彩超检查就可以明确这个诊断。可以在月经干净3-5天到医院去做彩超检查，如果有巧克力囊肿，先要观察囊肿的大小，如果小于5厘米，可以暂时继续观察，如果大于5厘米要考虑手术。
痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重。临床上多表现有小腹疼痛，小腹不适，白带增多，白带色黄，白带异味，月经失常，而且通常小腹内有一个坚实而无痛的肿快，有时性交会发生疼痛。
