进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
一般查体包括基本检查：身高，体重，血压；内科心肺听诊，外科腹部，乳腺，甲状腺等诊查；骨科，五官科，泌尿科，肛肠科，妇科等专科检查；心电图；影像检查：胸片；超声：肝胆胰脾肾，甲状腺，乳腺，颈部血管等。尿便常规化验，血常规，肝肾功能，血脂血糖的化验，一般男性45岁以上，女性40岁以上查肿瘤标志物。其余检查可根据自身疾病情况及要求增加项目。
肝炎检查项目包括乙肝两对半、肝功能、HBV-DNA检测、B超等。两对半主要是检查是否是乙肝病毒的。肝功能异常再做甲肝，丙肝，戊肝等检测，确定属于哪种肝炎。确诊属于哪种肝炎后，对症治疗。
月经推迟或提前一周都属于正常现象。如果不放心可以做早孕试纸测定或在停经42天左右做B超检查以明确是否宫内怀孕。如果想怀孕应该在排卵期同房，受孕的几率更大，排卵日是在月经前14天左右，排卵日的前5天和后4天属于排卵期。
早期脱肛与痔疮、肛乳头肥大症状相似，都是无痛性肿物脱出，极易造成不规范的小诊所及经验欠缺的医师误诊，因此，检查脱肛，先进的检查仪器必不可少。对于脱肛、痔疮等肛肠疾病的检查，还通过科学的专业仪器——德国GU-C四维超导造影检查系统。
