肛门脓肿主要来自于肛腺感染，可能与自身免疫力弱，解剖结构异常，排便习惯不良有关系，大便次数过多，大便不成形，或者是大便干燥，都可能是肛周脓肿的诱发因素，一旦诊断明确，肛周脓肿形成时应当及时手术治疗。
医学认为感染是疾病的主要原因。肛周脓肿可由肛裂、痔疮、肛窦炎、肛周皮肤滤泡性汗腺炎、肛周皮肤病等感染引起。某些疾病，如溃疡性结肠炎、再生障碍性贫血、全身营养不良，使身体虚弱，降低抵抗力，并诱发肛周脓肿。一般也会见到因为肛门直肠手术引起的感染，从而形成直肠周围脓肿。尿道术后感染、尾骶骨骨髓炎术后感染、产后会阴破裂缝合后感染等手术都可能引起脓肿。
可以使用一些药物进行治疗。肛周脓肿是发生于肛门、肛管和直肠周围的急性化脓感染性病，属于细菌感染，要给予抗炎治疗，脓肿成熟后可切开引流，给予营养丰富的食物，可多吃高蛋白，及富含维生素的食物，避免吃辛辣刺激性食物。
肛门功能损伤：肛周脓肿的发生一般都由肛腺感染开始。肛周有多个间隙，且周围组织较为疏松，一但一个肛腺感染，如不及时治疗，就会沿着各个间隙蔓延。感染跨过括约肌，手术就可能造成肛门括约肌的损伤，从而导致肛门功能的损伤。
现代医学认为感染是疾病的主要原因。肛周脓肿可由肛裂、痔疮、肛窦炎、肛周皮肤滤泡性汗腺炎、肛周皮肤病等感染引起。某些疾病，如溃疡性结肠炎、再生障碍性贫血、全身营养不良，使身体虚弱，降低抵抗力，并诱发肛周脓肿。一般也会见到因为肛门直肠手术引起的感染，从而形成直肠周围脓肿。
