腱鞘囊肿大部分需要做手术，但少部分患者不需要做。
一般情况下，肌腱鞘囊肿都是要做外科手术的，小部分病人可以自行吸收，但是可能会出现反复，或是周围严重的粘连。腱鞘囊肿可以通过外科手术来完全治愈，术后要将囊内的囊内全部取出，并立即进行封堵，同时加强包扎，避免再次发生。
患者平时应该饮食营养要均衡，多休息，避免剧烈运动和过度劳累，有利于身体健康。
出现腱鞘囊肿后不一定非得做手术进行治疗，可以先进行保守治疗，通过挤压让囊肿破裂，最终被身体自行吸收，也可以采取穿刺的方法抽出囊肿的积液，再进行加压按揉，也有一定的疗效，不过保守治疗容易复发，如果保守治疗无效，需要去医院进行手术切除治疗。
可以在门诊手术室就可以进行的。跟一般软组织手术愈合时间一样，一般伤口愈合要两个星期左右，其间一般要注意切口卫生，因为是无菌手术，一般不需要抗生素预防感染，预防肌腱粘连，3到4周一般恢复正常。
腱鞘囊肿手术一般2个星期左右能恢复。
腱鞘囊肿通常出现在手上，在肢体的末梢，例如手腕，手指，脚背，通常需要两个星期的时间，之后三天换一次，两周拆线，拆线之后一星期内要注意不能接触到水和沐浴，这时候可以进行适度的屈伸运动，但要注意不要做过于频繁的屈伸关节，以免出现肌鞘囊肿。恢复期间，患者应避免提拿重物，以免影响手术治疗的效果，导致恢复时间延长。
足背腱鞘囊肿的情况下，保守治疗无效，应及时进行外科治疗。术后要注意伤口的清洁和干燥，同时要注意换药，避免接触到水，以免引起细菌的化脓性感染。通常伤口在两周后就会痊愈。术后要多休息，不要做太多的运动，以免出现腱鞘囊肿复发。足背腱鞘囊肿手术后一般2周左右能恢复。足背腱鞘囊肿手术在术后3天左右，是切口肿胀最明显，1周左右伤口基本逐渐平稳，2周可恢复即可拆线。
