灰指甲的治疗需遵循科学合理的治疗方法，临床以应用抗真菌药物为主要治疗手段，不建议患者通过一些民间偏方、土方等没有科学依据的方法来治疗，以免加重病情。
感染灰指甲与真菌有密切联系，因此在治疗上需从杀灭真菌开始着手。抗真菌药物可分为口服和外用两种类型，绝大多数灰指甲患者可通过外用抗真菌药物改善症状，如亮甲复方聚维酮碘搽剂，该药是治疗灰指甲的常用药物，所含的聚维酮碘和阿司匹林能够起到杀菌抑菌、消炎止痒的作用，可改善灰指甲引起的多种不适症状。若患者症状较为严重，也可与特比萘芬、伊曲康唑等口服药物进行联用，治疗效果更好。
需注意的是，灰指甲的用药建议在医生的指导下进行，需足量足疗程，以免真菌残留，导致疾病复发。
轻度的灰指甲，比如很浅表的，没有明显增厚的，可以通过外用药来治疗。可以用冰醋酸，或者甲搽剂，像女孩子涂指甲油一样，涂在指甲上，但是含有药物的，还有一定渗透性。
白醋可以软化灰指甲。注意保持局部清洁卫生习惯，避免瘙抓，预防扩散。坚持使用抗真菌的药物控制，如想的软膏外涂。治疗灰指甲的方法很多，外涂药、内服药，外科手术拔除病甲等都非常有效。
治疗灰指甲一般这个严重还要通过拔甲，还可以配合用30%的冰醋酸溶液清洗，平常还可以用大蒜捣碎敷在上面，具体用药请遵医嘱。灰指甲容易出现指甲容易脱落，容易变脆，容易变碎，有可能还会引起指甲周围疼痛。
灰指甲用药都是可以治好的，基本上根据它受损坏的程度来选择方案的，如果指甲受损坏三分之一的话，用外涂药水，涂三到六个月，如果是指甲受损坏程度超过三分之一的话，可以用口服药物，口服药物基本上是用三个月左右时间，基本上都能够治好。
