腱鞘囊肿不及时治疗是有后遗症的，第一种后遗症就是造成一定的功能障碍，腱鞘囊肿会引发腕部无力，患处不适或疼痛，主要是酸痛或者是放射性痛，治疗得不及时，最后可能需要手术治疗。
皮肤囊肿手术后不会有后遗症。皮肤囊肿是一种良性病变，不必太担心，由于皮肤囊肿是一种良性病变，手术的难度是很低的，故而基本上手术后不会留有什么后遗症，不必太担心。
肾囊肿一般不会留下后遗症。如果是较小的肾囊肿，没有什么不舒服的，可以暂时不治疗，定期复查就可以了。如果是囊肿的直径比较大了，而且压迫症状，就需要做手术治疗了。一般没有严重的并发症，就是有可能会复发。
脑囊肿做了手术之后出现脑积水，还有出现颅内感染，这些都是后遗症。主要还是跟囊肿部位有关系。颅内感染，这个应该首先考虑还是因为患者没注意卫生，细菌生长引起。出虚汗首先考虑患者还是体质比较虚弱，同时可以增强体质。另外积极的配合医生治疗，积极治疗这些后遗症。
附睾囊肿手术后遗症有：附睾有时会出现小囊肿，多数都是潴留性囊肿，有炎症引起的囊肿比较少，如果没有症状，囊肿又比较小不需要治疗。如果症状比较明显，囊肿相对比较大，可以手术切除附睾。
进行乳腺囊肿的手术以后，并不会留下什么明显的后遗症，有一部分可能因为乳腺囊肿切除手术当中损伤了乳腺组织，在以后的哺乳当中会有一定的影响，不过影响也不大。注意观察自己的身体变化，如果出现异常应该及时去医院进行检查治疗。
