一般来说，主要是因为病毒细菌侵入身体，诱发呼吸系统和肠胃部感染，从而产生发烧。除此之外还有以下几个原因:一，不明原因发热，一般来说，临床上还采用发烧的狭义意义，发烧时间连续超过三个星期，患儿体温超过38.5摄氏度，经过细致的查问病史，身体检查以及寻常的体验检查，仍然不能确定发病原因。二，非感染性发热，不是由各类传染疾病诱发的，而是由各式炎症导致的身体体温调节中枢的混乱，或者是各式原因诱发的身体产热较多、放热较少，从而产生身体体温上升，异于正常体温的情况。
小孩反复高烧三十九度是由于呼吸道感染导致的，包括上呼吸道感染，如扁桃体炎，疱疹性咽峡炎，口腔溃疡。下呼吸道感染，如支气管炎，肺炎。或是消化道感染，神经系统感染，病毒性脑炎或者化脓性脑膜炎这两种疾病在发烧的同时合并有精神萎靡。
小孩反复高烧是病毒性的，病毒性的感冒发烧就是易反复发烧的，可给孩子查支原体抗体滴度，建议查血常规，crp等检查。发烧是很多疾病都有的症状，一定要把引起发烧的病治好了，发烧才能真正消退。
孩子反复发烧主要是抵抗力差。孩子不按时间吃饭、睡眠不足、营养不良等，都可能导致抵抗力差，从而引起反复发烧。此外，发烧的本质是病毒感染，但不能解决病原体感染的问题，所以就会反复发烧。
通常情况下，婴儿高烧可能是小儿急疹、感冒等原因导致的。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
如果孩子没有其它的临床表现，只是发高烧3天，然后全身发红，没有瘙痒等不适，精神状况良好，可能是因为小儿急疹所致。一般是因为流感导致的发热，同时还会出现咳嗽、流鼻涕、打喷嚏等情况。高烧是在感冒的高发期，宝宝出现发烧、退热不佳、反复发烧等表现，可能是感冒导致的高烧，需要服用一些特殊的抗感冒药。
婴儿反复高烧是病毒感染引起的病毒血症，急性期体温波动在39摄氏度至40摄氏度之间，随着病程进展出现咳嗽、流鼻涕、鼻塞等症状，如果婴儿全身状况良好，可以口服清热解毒的中成药。
