阴道毛滴虫病在治疗上都是消灭传染源和切断传染途径。可以采用中医治疗或者局部治疗。快速消除病理性组织，增强阴道防御能力。平时要注意个人卫生，保持个人卫生清洁，禁不洁性交，这样才有利于健康。
伴侣也一同进行治疗，期间不要吃辛辣刺激性食物，饮食清淡；不能同房，不要穿紧身裤，保持生理卫生。内裤、毛巾等应煮沸消毒至少15分钟；禁止婚外性行为以及预防性传播疾病，节制性生活。
口服用药配合局部用药，由于滴虫不仅寄存于阴道内，还有可能潜藏在泌尿道下段，前庭大腺和宫颈腺体内，这种情况单靠局部上药无法起到治疗作用，因此还需要口服用药。
少数患者临床表现轻微，甚至没有症状。查体可见外阴阴道粘膜充血，阴道分泌物多呈泡沫状、黄绿色。大多数病患表现为阴道分泌物增多、外阴瘙痒、灼热感，部分患者有尿频等症状。
阴道毛滴虫如寄生在尿道和膀胱内可产生滴虫性尿道膀胱炎，患者有尿频、尿急、尿痛、间歇性血尿、尿线中断、尿潴留和尿道红肿等症状。黄绿色泡沫白带增多。白带稀薄并有腥臭，若合并细菌感染则呈脓状白带并伴臭味。
间接传播，经公共浴池、浴盆、游泳池、坐便器、衣物等传染；那些阴道酸碱度有改变或免疫力低下的人群则更易于感染阴道毛滴虫病；阴道毛滴虫病诱因是经性交直接传播，男性感染滴虫后常无症状，因而很容易成为传染源。