谷酰转肽酶升高要排除酒精性肝炎，药物性肝炎，脂肪性肝炎和慢性的肝细胞炎症。所以，要结合其他指标来进行综合的分析，比如，有无饮酒史或反复大量的饮酒，有无脂肪肝的病史，有无药物的服用史。针对不同的病因来解决。酒精性肝炎，必须绝对戒酒。有服用导致肝脏损伤的药物，应停用，并且加强保肝降酶的治疗。
碱性磷酸酶和谷氨酰转肽酶高偏高时说明肝脏有损，可以进一步去医院做超声或ct检查，如果服用其他的药物，也有可能会引起药物性肝损害，但是主要是以转氨酶升高为主。
如果肝功能异常主要以谷氨酰转肽酶和碱性磷酸酶升高为主，那么主要病变在胆管，最常见的原因是结石引起的胆道梗阻，梗阻后引起肝脏本身轻度损害，故同时也可以见到谷丙转氨酶和谷草转氨酶的轻度升高，如果肝功异常主要以谷丙转氨酶和谷草转氨酶为主。
孕妇谷氨酰转肽酶偏高的处理方法取决于偏高的严重程度。
在孕期由于身体负荷增加，转氨酶轻度升高比较正常，一般不超过正常范围的两倍可以接受。如果孕妇谷氨酰转肽酶只是轻微偏高，此时不需要进行干预，定期复查即可。如果谷氨酰转肽酶远远超过正常范围3-5倍，需要化验肝炎以及做肝脏B超评估肝脏功能，可以使用保肝药物。
谷氨酰转肽酶偏高原因是肝细胞损伤造成的肝功能损害，而进一步产生肝功能减退，也可能是宝宝出生时误吸少量羊水或因为其他感染性原因，导致肺炎，可造成谷氨酰转肽酶升高。
乙肝小三阳碱性磷酸酶偏高，考虑乙肝处于活动期，这时候是需要进行治疗的，可以根据病人的情况，选择抗病毒治疗，或者是选择药物治疗，同时治疗期间在饮食方面不可以吃油腻的食品，要戒烟戒酒，多吃一些含高蛋白、维生素的食物，例如肉类，豆制品和奶类。
