治疗灰指甲通常需选用抗真菌药物来进行。因指（趾）甲生长较慢，角质层比较厚，治疗时间会比较长，因此治疗时一定要保持耐心，足疗程规范用药。
若患者指（趾）甲出现不规则变形的表现，一般需在用药前将变形的指（趾）甲修挫掉，再外用抗真菌药物，如亮甲复方聚维酮碘搽剂。亮甲是治疗灰指甲的专用药，所含聚维酮碘、阿司匹林等成分可起到杀灭甲下真菌、抑制真菌再生、消炎止痒、加快药物渗透的作用，患者可按疗程并足量用药，能较显著地改善指甲变形、变色、翘起、糟碎、脱落等症状。不过需注意，如患者有多个指（趾）甲都已出现病变，则可在外用药物的同时，遵医嘱与口服抗真菌药物搭配治疗，如特比萘芬、伊曲康唑等。
由于灰指甲治疗周期较长，故用药方面需注意规范，不建议患者采用民间偏方或土方治疗，可能会加重病情或延长治疗时间，对患者的健康造成损害。
灰指甲即甲癣，也叫甲真菌病，是由皮肤癣菌、酵母菌等真菌引起的指（趾）甲感染疾病，该病的治疗通常可通过抗真菌药物来进行。
灰指甲患者可使用含有抗真菌药效成分的外用或口服药治疗，常见为聚维酮碘、特比萘芬、氟康唑、伊曲康唑等。轻症患者可直接通过外用药物来改善病症，如以聚维酮碘为主要成分的亮甲复方聚维酮碘搽剂，该药不仅含有杀菌抑菌的聚维酮碘，同时还含有阿司匹林成分，能够在患处分解为水杨酸，起到消炎止痒、加快药物有效成分渗透的作用。若患者症状比较严重，也可与口服抗真菌药物进行联合治疗，可发挥较显著的疗效。
需注意的是，患者需基于自身病情，结合医生指导规范用药，不可盲目使用，以免加重病情。
不可以用中医治疗这个病，可以使用灰指甲的传统治疗方法，是在用药前用小刀刮削松脆的病甲，将病甲削薄，然后在使用相关药物涂抹，但是这种方法起码要坚持一年才能见效，很多病人往往由于碘的颜色、相关药物的气味以及疗程太长而中断治疗。
灰指甲基本上就是真菌感染引起的这个功能改变，病人可以去正规医院进行检查，然后根据自己的情况选择一些药物进行治疗。平时要注意。少吃油腻生冷辛辣刺激食物，也要尽量不抽烟，不喝酒。
中医对这个病效果不好，指甲受到真菌感染就是灰指甲。指甲会出现残缺或者是畸形，与体内缺乏维生素和微量元素有一定的关系，养成良好的卫生习惯，平时勤洗脚、勤换袜，保持干燥，经常更换床套，被套等。
