为了保证治疗效果和更好的恢复，必须要住院治疗，以免影响术后恢复。附睾囊肿是临床产科常见的一种疾病，一般的药物治疗是没有什么效果的，采取手术治疗是最有效的治疗方法。
手术一般是没有问题的，附睾头囊肿手术切除多余的囊肿并不是切除附睾，囊肿是属于良性病变，要先进行穿刺抽液，附睾及附睾囊肿切除后，后续应该配合消炎消肿治疗。平时要多卧床休息。
附睾囊肿的病因可能是睾丸和附睾发炎，也可能是性生活中的传染病。需要先确定囊肿的大小。如果囊肿不是很大，平时也没有不适症状，则不需要考虑手术治疗。如果囊肿很大，有明显症状通常需要手术治疗。
附睾囊肿如果超过三厘米，就可以考虑进行手术了，具体多大需进行手术并无一定界限。另外，还需情况判断，如老年人伴有糖尿病、高血压、心脏病等全身性疾病，感觉略微不适通常不建议进行手术，具体是否需要手术应至医院就诊再决定。
风险不是太大，附睾囊肿大多数为良性囊肿，正常不需要手术治疗。所有手术都会有风险，附睾囊肿手术的风险常见于麻醉所带来的风险，附睾囊肿手术正常采取硬膜外阻滞麻醉，麻醉过程中有可能会伤害到神经系统。
精索静脉曲张手术会引起附睾囊肿的。精索静脉曲张是精索静脉丛扩张，伸长而形成的阴囊血管性肿块，它95％发生于左侧，两侧较少.为青年人最常见的阴囊肿块之一，亦为男性不育症的重要原因。
