目前还没有专门的理论来解释卵巢囊肿的原因，但一般和遗传因素以及个体因素有关。
1、遗传因素：女性或外祖母患有卵巢囊肿的后代更容易得卵巢囊肿；
2、个体因素：正常发育时出现的良性囊性肿瘤，比如卵巢畸胎瘤。所有的患者都有不同的原因。
女性在做卵巢囊肿的时候，可以主观的触摸到附件区囊性肿物或者是包块。通过B超、彩超等检查，可以明确腹前区是否有囊性肿块，具体的可以通过磁共振和CT检查来明确。
卵巢囊肿引起的症状有小腹疼痛、小腹不适、白带增多、白带色黄、白带异味、月经失常，而且通常小腹内有一个坚实而无痛的肿块，有时性交会发生疼痛。当囊肿影响到激素生产时，可能出现诸如阴道不规则出血或毛体增多等症状。囊肿而发生扭转，则有严重腹痛腹帐、呼吸困难、食欲降低、恶心及发热等。较大的囊肿会对膀胱附近造成压迫，引起尿频和排尿困难。
巧克力卵巢囊肿一般指子宫内膜异位囊肿。通常情况下，子宫内膜异位囊肿目前为止病因还不清楚。子宫内膜异位囊肿是指卵巢内的异位子宫内膜组织周期性反复出血，形成被卵巢实质包裹的血肿，当具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢局部的时候，随着每次来月经异位症的病灶，在卵巢内也会出现出血的现象，患者可以通过囊肿剔除术、囊肿穿刺术、卵巢切除术等方式进行治疗。
卵巢囊肿分为卵巢生理性的囊肿和卵巢病理性的囊肿，生理性的囊肿也就是正常的月经中期出现的卵巢黄体囊肿。生理性囊肿顾名思义是正常的生理现象，不用做特殊的处理，随着月经的结束，卵巢生理性的囊肿都会自然地萎缩、吸收，不必做特殊的处理。病理性的囊肿病理类型是不一样的，包括卵巢浆液性囊肿和卵巢黏液性囊肿等。
如果由于炎症引起的卵巢囊肿，再抗炎治疗，以后大部分都会消下去的，就是如何判断这个卵巢囊肿，很难判断，所以说，如果有卵巢囊肿，在月经干净3到5天做b超，如果有，并且持续三个月，卵巢囊肿直径大于三公分，可以手术治疗。
长期的饮食习惯，如果女性的生活习惯差、心理压力大都会让女性的体制过度酸化让人体整个的技能下降导致卵巢内分泌失调免疫功能下降导致卵巢囊肿甚至癌变，内分泌因素：卵巢肿瘤大多都发生在未产妇的身上妊娠对于卵巢囊肿有着一些对抗的作用每日排卵导致卵巢表皮细胞这与卵巢瘤发生有关引起卵巢囊肿的原因之一。
