胆囊多发结石，如果是引起了明显症状应该手术治疗，大多数胆囊炎都是由于胆囊结石引起来的，可以吃一些药物调理。如果想彻底的治疗胆囊炎，可以手术治疗的办法，切除胆囊结石达到彻底根除。
对于输尿管结石的治疗原则是小于5毫米的不需要特殊治疗，可以自己排出；大于5毫米小于2厘米的可以做体外碎石治疗。大于2厘米的需要手术治疗。患者可以根据超声显示的结石大小进行治疗。同时多喝水，应用消炎药预防感染。
肝胆内管结石一般是需要进行手术治疗，需要经过一系列检查来确定治疗方案，比如保肝取石治疗方案等，期间不要吃辛辣刺激性的食物，多吃水果蔬菜，多吃含纤维素高的食物，保持大便通畅，加强体育锻炼，增加机体抵抗力。还有要合理睡眠，放松心理压力。
胆囊结石伴急性胆囊炎，对于症状明显或结石大于2厘米者可进行手术治疗，可选择腹腔镜微创手术，平时忌酒辛辣食物，清淡饮食，避免暴饮暴食。胆囊结石可引起急性胆囊炎，可表现为右上腹部疼痛、发热等，如引起急性胆囊炎可给予解痉止痛、控制感染等治疗。
肾结石应该进行手术治疗。肾脏结石需要根据结石的位置、大小及是否造成肾脏积水等多因素决定如何治疗。最常用的治疗方法是体外冲击波碎石。肾脏结石在2厘米以下的首选治疗方法，体外冲击波碎石无任何创伤。经过体外冲击波碎石后，需要定期进行观察随访，直至结石完全击碎排出为止。如果经过体外冲击波碎石治疗后的肾脏结石，没有任何的排出和改变，则可以选择手术治疗。
如伴有胆囊结石或胆囊萎缩，无功能者应行胆囊切除术，手术要慎重，可先作非手术治疗。包括低脂饮食服，消炎利胆药物，中医中药的治疗。如积极治疗无效又确切排除其他引起同样症状的疾病，仍可以考虑胆囊切除术。
