口腔溃疡通常限于疼痛、发红、肿胀等。在口腔里。手足口病通常伴有发烧，或红疹皮肤和四肢水泡。因此，应尽快注意调节和观察。然而，对症状的判断仍然存在局限性和错误。应该尽快对儿童进行血液检查，以帮助诊断疾病。确诊后，应根据疗程服药。
一般情况下，疱疹性咽峡炎与手足口病区别主要有症状不同、发病部位不同等。
1.疱疹性咽峡炎：主要是由上呼吸道的急性炎症引起的，也可以是单个的，突然的高烧可以达到40度，伴有咽痛、食欲差、不吃东西等症状，在悬雍垂、软腭、咽腭弓区都会出现几个或几十个灰色的小疱疹。另外，也可能是在口腔的其它地方，疱疹破溃就会形成溃疡。
2.手足口病：症状为低热、咽痛、食欲差、口唇上有散在的疱疹和溃疡，手足、手臂、腿、臀部等部位会有皮疹，个别儿童会有严重的全身症状。
一般情况下，疱疹性龈口炎通常10-14天左右能好，具体内容如下：
疱疹性龈口炎主要是由于单纯疱疹病毒导致的，在口腔的粘膜上会产生大量的充血、肿胀和大量的水泡。如果是单纯的泡泡，很可能会在10天内破裂，出现溃疡。在创伤处出现了细菌性溃疡，其修复期较长，一般需要14天。可以在伤口处涂抹一些红霉素素软膏，也可以用2%四环素溶液来漱口，促进恢复。
手足口病与水痘的区别就是手足口病是手和脚会长疱疹，并且口腔会有溃疡，而水痘一般全身任何一个地方都可能会长的，他们两个都属于病毒感染造成的，所以都很有可能会伴有发烧的症状出现，并且他们都会造成传染。饮食宜给予易消化、富含维生素的流质或半流质，发热时要多休息衣被不宜过厚过多，太热了出汗会使皮疹发痒。保持衣服、被褥清洁，以免继发感染。
手足口病与湿疹区别：皮疹位置不同。湿疹不单集中在手部或足部，肘关节、手部、足部、脸上都可能会有，而小儿手足口往往会出现在手足部位和咽峡部。形态不同。湿疹表现为皮肤的潮红，皮肤可能会出现糜烂或者是渗液，斑丘疹等改变，同时伴随明显瘙痒。而手足口的皮疹以疱疹为主，一开始可能为红点，但慢慢出现有水泡的疱疹，而且疹子长势随着横纹走向生长。分布规律不同。虽然小儿手足口的皮疹起的厉害会在肘关节、甚至臀部、膝关节，躯干出现，但手足口出的皮疹是离心性的，即是分布在四肢末端，而水痘的生长是向心性，即以分布躯干部位为主。
手足口病是一类病毒感染的统称，是病因。两者可重叠，即手足口病可表现为口腔溃疡的可能，口腔溃疡可由很多病因引起手足口病病毒是其中之一。手足口病是病毒感染引起，口腔溃疡病因不明确，但是于病毒感染关系不大。手足口病主要时学龄前儿童多见，主要表现为口腔黏膜糜烂溃疡多呈多发，同时伴有手及足部水疱，严重时会涉及臀部，伴有发热，有传染性，需要积极抗病毒及支持治疗。
