口腔溃疡的治疗主要是促进愈合，减少复发。促进愈合的治疗，主要有两个方面，一是预防感染，可以含漱抗感染的漱口水。二是促进黏膜修复，局部应用生长因子喷雾剂贝复剂，副作用较小效果好。特别是深大溃疡，长期不愈合的效果肯定；促进黏膜修复也可以局部应用激素，激素副作用较大，不能长期使用。减少复发，主要是西药调理免疫功能，中医中药辩证调理。局部减少创伤，防止形成溃疡。
口腔溃疡不仅给患者的生活和工作带来很大的痛苦和不便，更严重的是长期的反复发作将直接影响患者整个机体的免疫功能。如果口腔溃疡反复发作甚至此起彼伏，疼痛难忍或伴有其他部位的溃疡。
经常性口腔溃疡的原因是缺乏维生素或微量元素缺乏、营养不良、吃油腻油炸、辛辣刺激性食物导致上火出现口腔溃疡或者是长期服用西药时间长，容易产生副作用和抗药性；不重视口腔溃疡，没有注意饮食和口腔卫生问题，导致口腔溃疡反复发作和没有注意休息时间，导致内分泌失调紊乱；口腔溃疡可以使用西瓜霜喷剂喷涂溃疡部位，可以减少疼痛和加快溃疡愈合。
考虑牙龈炎，口腔溃疡一般和上火缺乏维生素或者免疫力低下有关系，牙龈炎治疗可以进行洗牙，可配合全身的抗菌治疗，平时多食蔬菜水果，不要吃辛辣刺激性的食物，尤其是辣椒烟酒一类的。
患有口腔溃疡和身体里面所缺维生素有一定的关系，患有口腔溃疡的情况下是可以吃鸡蛋的，只是不要吃辣椒炒鸡蛋，否则会导致口腔溃疡更加严重，一定要注意多饮水，因为多饮水能够有一定的缓解效果，还要注意多食用一些含有维生素的蔬菜和水果。
经常出现口腔溃疡一般考虑是复发性的口腔溃疡，要减少溃疡的复发，尽量延长复发的间隔期，需要全身应用药物，主要目前应用的还是免疫增强剂，包括肾上腺皮质激素或者左旋咪唑现在应用比较多，能够有效的调节身体的免疫状态，能够有效的减少口腔溃疡的复发。
