治疗可以用：局部灌肠疗法：使较高浓度的药物直接作用于病变部位，以增强杀菌作用，并刺激肉芽组织新生，一般作保留灌肠。抗生素治疗：在决定应用抗生素时，应考虑到疾病的严重程度，病人的年龄，卫生状况，进一步传播的可能性和造成细菌耐抗生素的可能性。此外，早期用适当的可吸收的抗菌药物治疗，可明显减轻症状和减少志贺菌的排出。
治疗的方法有病原治疗法通常需联用两种不同类型的抗菌药物，足剂量、长疗程。对于肠道黏膜病变经久不愈者，可采用保留灌肠疗法，还有对症治疗的方法，保持水、电解质和酸碱平衡，有失水者，无论有无脱水表现，均应口服补液。
治疗的方法有抗感染的治疗方法，选择敏感抗菌药物，静脉给药，待病情好转后改口服。还要局部灌肠疗法：使较高浓度的药物直接作用于病变部位，以增强杀菌作用，并且刺激肉芽组织新生，一般作保留灌肠。
一般情况下，婴儿出现细菌性痢疾应该做好以下几点：
1.婴儿出现细菌性痢疾，家长应及时带婴儿去医院就诊，并留取婴儿的大便进行检查。
2.如果婴儿出现细菌性痢疾，但病情比较轻，可以在医生指导下服用阿莫西林、头头孢克肟颗粒等药物进行治疗，病情较重的，需要住院治疗，。
3.婴儿出现细菌性痢疾，治疗期间，家长应注意婴儿的清洁卫生，家长也要做好防护，以免交叉感染。
抗菌治疗，可使用抗菌药物，静脉点滴或肌肉注射，有效地控制感染；对症支持治疗，比如积极控制高热惊厥、及时进行抗休克治疗、维持水电解质酸碱平衡等。出现肠道菌群失调时，还可以应用益生菌，以利肠道正常菌群恢复。
出现粘液脓血便以及里急后重，多数是由于急性痢疾所引起的。应该及时到医院化验大便常规的检查。诊断明确后应该及时应用药物进行治疗。要注意饮食调理，不要吃辛辣刺激性食物，避免受凉。平时要注意饮食，不要暴饮暴食。可以少量多餐，吃易消化，营养丰富的软食。
