巧克力囊肿做腹腔镜手术是不会疼的，因为在手术中会用到全麻，病人会在麻醉结束后昏迷。
手术完成后，患者可能会出现小腹的疼痛和不适，这是因为麻醉药物药力会逐渐减弱，直至消失，但这种不适症状通常在术后24小时能够自行消失。做手术之后一定要卧床休息,不要做剧烈的运动,还要注意腹部保暖,避免着凉，饮食以清淡、营养为主。
巧囊术后腰痛不一定是手术引起的，不知道您是用的哪种麻醉方式，是腰麻的话，考虑可能是麻醉后引起的，具体还是到医院去看看，腰椎的麻醉的话是可以引起以后的腰酸的症状的，是加强腰部的锻炼活动改善。
腹腔镜手术后伤口痛可能是术后感染、伤口撕裂等原因导致的。
一般地说，大部分普通外科的手术，腹腔镜手术都能完成，如阑尾切除术，胃、十二指肠溃疡穿孔修补术、疝气修补术、结肠切除术、脾切除术、肾上腺切除术，还有卵巢囊肿摘除、宫外孕、子宫切除等，而如果腹腔镜手术后伤口痛，可能是术后感染、伤口撕裂等原因导致的。，建议注意去医院检查，然后使用抗生素进行治疗。
麻醉成功之后，会在肚脐以及肚脐的两周，总共切4个小的刀口。然后将所有的器械都进入到盆腔观察情况，找到巧克力囊肿，将其提起。先进行穿刺，将囊肿里面的液体引流，再将囊肿里面血液冲刷，之后进行巧克力囊肿的剥离。剥离之后再进行缝合和止血。缝合结束之后需要进行盆腔的冲洗。再检查盆腔内没有异常出血，将器械撤出，手术就结束了。
通常情况下，卵巢囊肿腹腔镜手术7-10天左右能出院。具体分析如下：
卵巢囊肿患者如果实施了腹腔镜手术，一般有7-10天左右能够出院，在这个过程当中，患者伤口需要恢复，而且身体的机能也需要恢复一段时间。可能需要在医院当中使用一些消炎的药物来控制感染的症状，这些都需要一个疗程，大概7天的时间才能使症状得到控制。也有一些患者存在特殊情况，例如在手术期间出血比较多，或者手术以后感染比较严重，还可能会增加住院的时间。
腹腔镜手术有多种，腹腔镜胆囊切除术术、阑尾切除术，疝气修补术等手术，术后如果没有异常，一般1-3天可以出院。如果是进行肠道肿瘤手术，如结肠癌肠切除，低位直肠癌手术，就需要拔掉引流管，一般需要10天左右才能出院；
如果出现并发症，住院的时间会更长，还有比较复杂的腹腔镜手术，住院的时间要根据恢复的情况来定。
