可以检查脑实质，侧脑室，中线结构，鞍区，双侧乳突，双侧眼球及眼眶，以及部分鼻窦和鼻咽。磁共振在临床上的应用非常广泛。磁共振检查头部，对于头部所存在的绝大部分问题都可以查出来，磁共振对软组织的检查更具优势。
脑部做核磁共振的检查要优于CT的检查。因为核磁共振的检查更清晰，特别是后颅窝的病变，当CT检查时因为有颅底颅骨的伪影，对脑干和小脑有可能会存在一部分伪影的现象，所以对于一般的病变的检查核磁共振更好。
做头部磁共振的时候，跟磁共振检查都是一样的。首先就是自己做好准备，肚子不要太饿也不要太饱，大小便先排掉，这样就会比较轻松一些。另外就是身上的金属异物都要拿掉，尤其是发卡。
病毒性脑炎病人去医院复查需要做头部部核磁检查，如果是病毒脑或结核性脑炎病人在康复期有必要复查一次腰穿，可以直接确定和判断是否完全恢复正常，颅内是否仍有异常情况。
脑部磁共振在临床上的应用非常广泛，磁共振对于头部及其器官的绝大部分问题，都可以查出来。因而，磁共振对脑颈的检查具有很大的优势，如脑颈部是否存在有肿瘤出血，梗塞或是血管畸形等问题。
婴儿核磁共振检查头部是没有影响的，做四维检查基本可以看出脑回路的发育情况，出生以后宝宝出现脑瘫的情况，是比较麻烦的，并且很难治。所以现在非常需要给宝宝进行确诊。做核磁共振是没有关系的，这一点您是完全可以放心的。
