如果计划进行穿刺检查，通常在住院后进行。这表明必须选择正规的公立医院进行泌尿外科治疗，而不是一些所谓的私立男性医院。治疗后，应该首先向接受治疗的医生解释目的。经彩色多普勒超声、穿刺等检查后，应确保诊断后有针对性的治疗。
为了保证治疗效果和更好的恢复，必须要住院治疗，以免影响术后恢复。附睾囊肿是临床产科常见的一种疾病，一般的药物治疗是没有什么效果的，采取手术治疗是最有效的治疗方法。
比较小，单一的附睾囊肿是不需要治疗的，如果是比较大的囊肿，或者短时间内增大的囊肿，或者是多发的附睾囊肿可以考虑手术进行切除，一般是手术过程中用蚊式钳分离附睾囊肿，把囊壁完全切除即可。
手术一般是没有问题的，附睾头囊肿手术切除多余的囊肿并不是切除附睾，囊肿是属于良性病变，要先进行穿刺抽液，附睾及附睾囊肿切除后，后续应该配合消炎消肿治疗。平时要多卧床休息。
附睾囊肿如果超过三厘米，就可以考虑进行手术了，具体多大需进行手术并无一定界限。另外，还需情况判断，如老年人伴有糖尿病、高血压、心脏病等全身性疾病，感觉略微不适通常不建议进行手术，具体是否需要手术应至医院就诊再决定。
附睾囊肿的病因可能是睾丸和附睾发炎，也可能是性生活中的传染病。需要先确定囊肿的大小。如果囊肿不是很大，平时也没有不适症状，则不需要考虑手术治疗。如果囊肿很大，有明显症状通常需要手术治疗。