这种蛋白主要来自胚胎的肝细胞，胎儿出生后约两周甲胎蛋白从血液中消失，因此正常人血清中甲胎蛋白的含量尚不到20微克/升。所以，如果只有甲胎蛋白偏低，而无其他症状，这是正常的，不必担心。
脂肪肝是可以引起甲胎蛋白升高的，任何情况下，只要能够引起肝功能损伤都有可能出现甲胎蛋白升高的现象，如果甲胎蛋白没有持续性明显升高，是没有诊断肿瘤的临床意义的。
肝炎活动期甲胎蛋白一般不会超过1000。
乙肝活跃期间，肝细胞会发生再生，也会引起甲胎蛋白增高。但由于甲胎蛋白的增高，一般不会高于400ug/L，而且会在一定程度上降低，所以如果甲胎蛋白高于1000ug/L，就要考虑是否患有肝癌。
通常情况下，若甲胎蛋白在200ug/L以上，连续4个星期，或400ug/L以上，并伴有肝造影，可确诊为肝癌。
所以，如果乙肝活跃期的甲胎蛋白高于1000ug/L，需要做肝脏增强CT、增强磁共振、肝血管造影等方面的检查。
肝囊肿是不会导致甲胎蛋白升高的，甲胎蛋白是原发肝癌的肿瘤标志物，像肝炎，肝硬化，也可能引起甲胎蛋白升高，所以可以进一步的检查身体，看看身体是否还有其他的肝病症状。
孕妇甲胎蛋白偏高的治疗方法如下：
女性在怀孕后出现甲胎蛋白偏高的原因可能是因为怀孕后,胎儿体内会产生甲胎蛋白,这是人体在胚胎时期血液中含有的一种特殊蛋白。正常情况下，会在孕期中期会逐渐恢复正常，不必过于紧张担忧。必要时，及时去医院进行检查，在专业医生的指导下进行对症治疗。另外，在孕期，孕妇需要定期去医院进行产检，观察胎儿的发育状况。
甲胎蛋白偏低，低于正常水平的甲胎蛋白可能有唐氏综合征的危险。但一般来说，AFP需同时结合其它检查——绒毛膜促性腺激素（hCG）及妊娠相关血浆蛋白A（PAPP-A）对筛查唐氏综合征才有意义。
