通常来说，枸橼酸氯米芬胶囊的副作用比较大。
枸橼酸氯米芬胶囊是促排卵药物，主要用于治疗卵泡发育不成熟引起的不孕症，也可以治疗患者黄体功能不足，补充黄体酮。而枸橼酸氯米芬胶囊引起的不良反应主要是胃肠道不适，出现胃痛，胃胀，食欲不振，便秘和腹泻等，还会引起盆腔和下腹部的疼痛。因为对激素分泌有调节作用，所以会引起头痛，头晕，精神紧张，还会改变月经，引起月经量增多或者不规则出血。
达菲林的主要作用是抑制卵巢功能，如果在月经周期的第五天，也就是来月经的第五天左右注射达菲林，一年后月经就不会来了。此药注射后会缓释作用于身。药效持续28天，而后卵巢功能缓慢恢复，大约药效结束后30—60天卵巢功能恢复正常。
枸橼酸氯米芬片是调节排卵周期的内分泌调节药物，用于治疗不孕症。临床上应用于无排卵和排卵障碍，以及辅助生殖中的排卵刺激药物。低剂量的药物可以促进垂体前叶中促性腺激素的分泌，从而诱导排卵，高剂量可显着抑制垂体促性腺激素释放，促进男性精子发生，有效对抗少精子症，可以改善肺癌患者术前临床症状为手术创造条件。
枸橼酸莫沙必利分散片具有促进胃肠动力的作用，属于促动力药物。主要适用于治疗慢性胃炎引起的恶心、呕吐、上腹闷胀不适、消化性溃疡、急性胃肠炎、消化不良等症状的使用。
男性对于达菲林的药副作用是轻微骨痛、潮热、性欲减退、阳痿等。达菲林对于女性的副作用是子宫内膜异位的同款症状、骨痛、痛经、腹痛、子宫出血、卵巢肥大、阴道干燥、性交困难等。有些儿童也会用到达菲林，因此也会出现皮疹、水肿、皮肤瘙痒、呕吐、恶心、发热、体重增加等。
这个药为胃粘膜保护剂，在胃里面形成弥散性的保护层覆盖于溃疡面上，阻止胃酸及食物对溃疡的侵袭，促进溃疡粘膜再生和溃疡愈合。还有杀灭幽门螺旋杆菌的作用，也用于复合溃疡、多发溃疡、吻合口溃疡与糜烂性胃炎等。