脑血栓后遗症主要通过药物治疗和康复功能锻治疗来进行。药物治疗主要是使用具有活血化瘀、芳香开窍疗效的中西药防止血栓复发。康复功能治疗则是配合按摩理疗等辅助手段，逐渐改善血循环状况。脑血栓康复治疗是一个长期的过程，必须持续用药和锻炼。
从中医上看，脑血栓都是由瘀血阻滞络脉造成的，但引起瘀血的原因，则不完全相同，而们治疗脑血栓大部分是治疗脑血栓后遗症和预防再次出现脑血栓，所以分清瘀血的形成原因，并加以治疗，就显得非常重要。
可以练对指运动，做精细的动作，肌力、肌张力差的也要锻炼，脑血栓形成是脑梗死最常见的类型。是脑动脉主干或皮质支动脉粥样硬化导致血管增厚、管腔狭窄闭塞和血栓形成，引起脑局部血流减少或供血中断，脑组织缺血缺氧导致软化坏死。
脑血栓后遗症主要表现为肢体活动的障碍，同时存在异常头痛，或者有语言障碍，主要因病人的梗塞部位而异，主要的方法是选择性地进行对症疗法。也有控制血压的情况，配合针灸、按摩和康复锻炼。
脑血栓后遗症不能治疗，脑血栓的后遗症，主要是根据血栓形成的部位，是大脑的哪一部分发生了缺血、变性、坏死而遗留下来的症状。不同部位梗塞，血栓所出现的症状是不同的，留下的后遗症也是不一样的。
