三个月宝宝睡觉老是摇头可能是缺钙、窒息缺氧病史等原因导致的。
1.缺钙：如果家长没有及时给三个月宝宝补充维生素D，可能会影响钙的吸收，容易导致缺钙，可能会引起神经兴奋性增高，导致睡眠不安，从而出现睡觉老是摇头的症状。
2.窒息缺氧病史：如果三个月宝宝出生的时候有窒息缺氧病，可能会影响正常的脑部功能，容易影响睡眠状态，从而出现睡觉老是摇头的症状。
一般情况下，宝宝三个月睡觉老是摇头可以是以下原因导致的：
宝宝三个月睡觉老是摇头，这就是维生素D和钙质的经典表现。缺乏维生素D和钙质的宝宝三个月会导致神经肌肉的兴奋，主要是由于汗腺的分泌增加，汗珠会刺激到头部，如果觉得痒，就会在枕头上来回的晃头，导致宝宝三个月睡觉老是摇头。还有就是睡眠浅、睡眠不安详，稍有一点声响就会惊醒，也会导致宝宝三个月睡觉老是摇头。
孩子爱哭，首先可以考虑可能是由于缺乏微量元素引起的，缺乏必要的钙质和锌，会导致孩子出现爱哭闹，夜班盗汗，睡觉翻身，磨牙，放屁的症状，带孩子去做一个微量元素的监测，确认以后可以给孩子补充钙质和锌。
有些宝宝夜里进入深睡眠时会出许多汗，甚至整件内衣都会湿透。很多情况下，宝宝出汗多并不是生病、体虚或者缺钙，而是身体的自然反应。夜里睡觉出汗多，首先要考虑是不是太热了。宝宝睡觉的房间，16~21℃是比较舒适的温度，切忌过热。娃睡觉时，给Ta穿盖厚薄合适的睡衣或睡袋即可。判断孩子冷热的标准是脖子温热，小手不凉，如果摸到脖子有汗，就要减少穿盖了。如果屋内温度适宜，宝宝穿着不厚，但仍然出汗很多。
三个月的宝宝睡觉老是摇头一般是缺钙、湿疹、植物神经紊乱等原因导致的。
三个月的宝宝处于成长发育的重要阶段，如果平时进食不当可能会导致三个月宝宝缺钙，造成交感神经兴奋，引起三个月的宝宝睡觉老是摇头。三个月的宝宝身体新陈代谢比较快，可能脖颈部出汗较多，此时可能会导致湿疹，造成瘙痒，引起三个月的宝宝睡觉老是摇头。同时三个月的宝宝神经发育不成熟，可能会出现植物神经紊乱的情况，造成三个月的宝宝睡觉老是摇头。
小宝宝睡觉摇头、手脚乱动是典型的缺少维生素D和钙的症状。缺钙的宝宝副交感神经兴奋，引起的腺体分泌增多、出汗多，汗液刺激宝宝头皮痒，这是宝宝摇头的原因，经常摇头可致头发脱落，形成枕秃。
