脑血栓的治疗主要分为内科治疗、外科治疗和后期的康复治疗三种。内科治疗主要是在脑血栓的急性期，可以使用溶栓或者降纤的治疗，并且进行脑保护治疗，防止因为脑血栓而导致的并发症的出现。如果脑血栓的面积比较大，出现了脑水肿甚至脑疝的形成，可以通过手术减压。
药物治疗：早期治疗是治疗脑血栓的关键，治疗时间窗内溶栓治疗，并降低脑代谢控制脑水肿及保护脑细胞。外科治疗：小脑梗死使脑干受压导致病情恶化的病人通过抽吸梗死小脑组织和后颅窝减压术可以挽救生命。
脑血栓形成，是由于脑血管堵塞以后，引起的临床症状。患者会表现为偏瘫、失语，甚至意识障碍、感觉迟钝等。脑血栓形成的治疗，就是在发病的超早期，也就是4.5小时以内，积极进行溶栓治疗，包括动脉溶栓和静脉溶栓。如果错过了最佳溶栓时机，需要积极进行脑保护治疗。
脑梗死起病后，应及早就医，愈早来院愈佳。
如果错过最佳救治时机就会危及患者生命，可溶栓治疗，以三个小时内为宜，接下来的4-5小时内，至迟不超过六个小时。如果错过这个时间就会影响疗效。目前临床上对于急性脑梗塞主要采用药物溶栓进行治疗。有条件者，医院及家属亦可选择血管内介入对脑梗死进行治疗，但适应证的选择要严格。对于急性缺血性脑卒中患者进行及时有效的干预是非常重要的，这将对减少致残率、提高生活质量起到积极作用。脑梗死治疗一般以抗血小板聚集，降血脂等为主。还要对脑血管病危险因素进行处理，对血压，血糖，血脂等进行控制。对于脑血栓形成患者需要进行抗凝药物治疗，并且使用肝素类药物。其他疗法有康复训练、康复治疗等。
通常情况下，针对脑血栓的治疗，主要以应用药物为主。
脑血栓急性期常表现为头晕、呕吐、意识障碍等症状，此时患者若处于静脉溶栓窗口期内，可及时送往医院进行检查，若无相应禁忌症，可行静脉溶栓治疗。
此外，脑血栓患者可长期服用通心络胶囊进行治疗，通心络胶囊是络病理论指导下的代表方剂。该药物以人参、水蛭、全蝎、蜈蚣等药材配伍而成，组方独特，具有益气活血、行气止痛的功效。患者服用后见效快，效果好，可帮助预防脑血栓症状的发作。
