如果得了肛门囊肿，药物的治疗是没有什么太大意义的，通过手术的方法进行治疗。还是能够到医院进一步进行判断，是肛周的脓肿还是肛周的囊肿，如果是肛周脓肿，需要及早的进行手术治疗。
肛门囊肿也就是临床上常说的肛周脓肿。对于表浅的脓肿，可以选择口服抗凝药物，一般常用的广普的抗凝药物。对于范围相对较大的脓肿还需要联合用药，可以选择氨基糖苷类抗生素，以及抗厌氧菌的药物。
不要用手去接触囊肿的地方，用洁净的纱布把它包好盖住。这种病一般只有通过手术才能治疗好，所以要赶紧把新生儿送到附近的医去治疗，当医生给新生儿做完手术后，家长要按照医生的要求去办，例如怎样吃药，如何去预防。还要做好新生儿肛门周围的清洁工作，在囊肿的病好了之后，要养成每天都给新生儿清洗的好习惯，尽量时刻保持屁股周围干爽。新生儿还会经常尿尿拉屎，还要经常换洗尿布。
肛门囊肿通常指的是肛周脓肿，是因为直肠肛管组织内或者周围间隙内的感染而形成囊肿一。大部分的囊肿在破溃或者手术切开引流后容易形成肛瘘。肛周脓肿是属于炎症过程中的一个急性期，而形成肛瘘以后则进入慢性期。
肛门囊肿通常指的是肛周脓肿，是因为直肠肛管组织内或者周围间隙内的感染而形成囊肿一。大部分的囊肿在破溃或者手术切开引流后容易形成肛瘘。肛周脓肿是属于炎症过程中的一个急性期，而形成肛瘘以后则进入慢性期。