宝宝起床后咳嗽的原因有很多，要看具体情况而定，如果是宝宝之前有支气管炎肺炎等呼吸系统疾病，好了后出现晨起咳嗽考虑是疾病恢复期，口服些止咳化痰药对症治疗即可，如果宝宝晨起咳嗽，同时有流清鼻涕，打喷嚏，揉鼻子揉眼睛，湿疹等表现考虑是过敏引起的咳嗽，也可能是哮喘，需要到医院就诊完善相关检查，还有如果室内空气比较干，睡一宿觉也可以出现咳嗽的。
醒来就咳嗽的现象还是比较常见的，最常见的原因还是发生了呼吸系统感染，在晚上睡觉的时候人体的咳嗽中枢会受到抑制，所以咳嗽的现象就会减弱，会出现睡着不咳嗽，醒来的时候就会出现咳嗽。
一般情况下，宝宝夜里咳嗽可能是以下原因导致的：
宝宝夜里咳嗽，主要是因为房间里面的气温比较高，而且空气比较干燥。如果是这样的话，可以在房间里放置一个加湿器来保持湿度，同时还要将房间的气温维持在25摄氏度。过敏性咳嗽的典型特征是阵发性的、刺激性的干咳，经常在晚上突然出现或加剧，因此宝宝夜里咳嗽可能是过敏性咳嗽导致的。
咳嗽主要分为外感咳嗽和内伤咳嗽。外感咳嗽主要指外界风寒燥热等侵犯机体引起的咳嗽。内伤咳嗽，是从体内发出的，如果多食用煎炸油腻的食物，引起痰湿、燥热、肝火等造成咳嗽。
是呼吸道有细菌感染引起的，是体内有火的表现，平时注意保暖，不要受风和受凉，可以进行药物，或中医保守治疗，严重时需要输液治疗。注意多喝水，饮食有营养。注意多喝水，保持新鲜空气。
宝宝咳嗽常是由于体内有病毒、细菌、支原体、衣原体、立克次体等病原体入侵，而发生呼吸道黏膜的充血、水肿和炎性物质渗出的炎症反应。其内含有大量的活的和死亡的病原体、炎性代谢产物和脱落的组织碎片。咳嗽剧烈时会刺激到食道咽喉部而引发反射性的干呕。多见于急性咽炎、急性扁桃体炎、急性支气管炎等。此时可以检测血常规，必要时拍一下双肺x光片，明确诊断和治疗方案。
