精子畸形率高的原因包括感染、个人的生活习惯、工作环境、染色体的异常等。
第一，精子畸形率较高，主要有支原体，衣原体，普通细菌等，还有疱疹病毒感染体，巨细胞病毒感染等。
第二，饮食不当、酗酒、抽烟等都会导致精子畸形。
第三，工作环境，长期从事焊接，长时间处于高温下，长时间暴露于化学物品中，都会导致精子异常。
第四，有些病人可能因为技术上的原因，或者是染色体的不正常，导致了高的精子畸形。
影响胚胎停育可能是精子染色体畸变或精子核不成熟，均可导致胚胎发育异常或终止，是造成女性流产的最常见的男方因素。也可能是黄体功能不良，黄体功能不全可造成子宫内膜发育迟缓和黄体期短，从而影响受精卵的种植，或早期妊娠流产。
引起的原因有：不健康的生活方式，酗酒也是常见的造成精子畸形的原因之一：已有研究证实，酗酒产生的酒精中毒可能损伤精子，造成精子畸形率增高，同时还可造成性欲冷漠、阳痿、早泄等性功能的异常。再者男子泌尿与生殖系统的某些感染：也是造成精子畸形的重要原因之一。较常见的影响精子畸形的感染，如：前列腺炎、精囊炎、尿道炎等。
致畸形精子多的原因主要是抽烟、喝酒、环境污染或疾病等导致的。建议首先要避免接触有毒有害物质，禁烟酒，避免污染环境影响。同时可以配合用中药调理。也可以进一步针对做下精子形态学和生精细胞学等检查查明具体导致精子质量下降原因。针对性的治疗效果显著，生活上注意卫生饮食清淡有营养，适当身体锻炼，避免久坐或长时间处于高温状态下工作环境要注意更换。
精子畸形率高直接原因多见于睾丸炎或附睾炎所引起的症状。患有精子畸形率高应去做详细的检查后进行治疗。同时应戒烟戒酒，多吃营养丰富的食物。正常成年男性的精液中，也存在着一些异常的精子，所占比例低于30%，多不会引起生理和生育功能。如果畸形精子率超过50%以上，则称为高畸形率和导致不孕不育症的发生。
酗酒、吸烟会导致精子畸形。泌尿生殖系统感染，是造成精子畸形的一个主要的原因。内分泌紊乱。化学制剂、环境污染以及辐射等因素，都很可能会造成精子畸形的发生。另外，戒烟酒，忌食辛辣刺激性食物。
