龟头流脓考虑是包皮过长引起的细菌感染，或者性生活不洁导致的病菌感染。可以化验一个龟头的局部分泌物，和尿道的分泌物尿液，最终确诊是什么病菌导致的。小便刺痛一个见于泌尿系的炎症刺激定位就是湿热下注导致的。
龟头流脓一般多见于龟头炎等导致，可以到医院外科就诊检查，根据病情采取清创消毒治疗，然后选择消炎药治疗。另外可以做一下尿常规等检查，如果是细菌感染，可以使用药物类等消炎药治疗，注意多喝水，不要吃辛辣食物，暂停性生活，不要喝酒。
小便刺痛龟头流脓，首先需要考虑是尿道炎的可能性。尿道炎一般分为淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎两种情况。淋菌性尿道炎的致病菌指的是淋球菌，而非淋菌性尿道炎的致病菌一般是支原体或者是衣原体。
考虑是龟头炎，龟头炎龟头粘膜的炎症称龟头炎。本病可因各种病原体感染、局部刺激等因素引起。抗感染治疗，过敏性因素引起，去医院检查分泌物性病系列，确诊什么感染，然后对症下药。
小便刺痛、龟头流脓考虑是尿道炎合并龟头炎引起的不适，可能是念珠菌感染引起的。考虑与尿路感染或淋病有关系的，可以进一步检查尿常规和做尿道分泌物检查，到当地医院做个尿常规检查，如果有不干净的性生活考虑淋病可能。应该及时治疗。
尿有刺痛感、流脓需检查尿道口脓液，以确定引起尿道炎致病菌，以便选药处理。
若因大肠杆菌、淋球菌及其他感染所致，病人可口服头孢克肟分散片、头孢拉定胶囊等头孢类抗生素治疗。若由于支原体、衣原体感染所致，病人可口服如阿奇霉素、米诺环素大环内酯类抗生素治疗。
但是以上药物都需要在医生的指导下使用，以免损害身体。
