在临床中，出现头部疼痛的症状，可以做CT检查，也可以做磁共振检查，这两种检查方式都有自己擅长的一面。如果怀疑头部里面有脑出血，最好做CT检查。如果怀疑头部里面有梗塞，或者是脑白质方面的问题，需要做磁共振检查。当然，如果身体里面有金属、安装有心脏起搏器之类的东西，不能够做磁共振检查，只能选择做CT检查。在临床中，磁共振检查的费用比CT要高得多。所以，出现头部疼痛，选择哪种检查方式，还是需要根据病情决定，并不一定价格更高，检查效果就更好，具体问题需要具体分析。根据检查结果再选择治疗方案，要及时处理，以免延误病情。
腰疼拍CT还是核磁共振，需要根据具体情况来定：
第一种是腰椎间盘突出、腰椎管狭窄、腰椎压缩性骨折等疾病，可以采用CT扫描来明确诊断。第二，腰椎核磁检查的主要适用于高位腰椎间盘突出，以及多节段的腰椎间盘突出，一般CT不能完全反映腰椎的突出情况。所以当腰椎突出范围很大的时候，最好做核磁共振检查。另外，腰椎血管瘤、原发性腰椎、继发恶性等疾病，需要进行MRI检查，以明确病变存在部位、骨质破坏的情况。
头痛做核磁共振好，磁共振主要用于检查颅内器质性病变引起的头痛。头痛是一种症状，可由多种疾病所引起。常见的疾病包括颅内器质性病变，也可能是由于原发性头痛疾病所引起。
头疼拍ct比较好。头痛是日常生活中的常见症状，CT检查较实惠，较低费用即可解决部分较大的问题，如是否存在肿瘤或出血等，且大部分引起头痛的原因通过CT检查即可解决；若出现神经痛或颅脑神经压迫病变，MR检查效果更好，但MR收费相应较高。若患者出现头痛现象，医生将根据头痛不同的性质、部位、症状安排不同检查。若患者为持续、反复跳痛，且疼痛迁延不愈，则应进行磁共振检查观察神经的情况。引起头疼的原因是比较多的，建议根据头疼的原因进行选择，可以在医生指导下进行相关检查，确诊后治疗。
脑ct和核磁共振的区别，主要是这两种检查方法的原理是不同的。脑ct主要是通过x线的照射，通过人体不同部位，不同组织的吸收后，有探测器回收信息，然后通过一系列的数模转换，最后由电脑重建得出图像。核磁共振是利用人体内含有的大量水份，将水中的氢离子重新排列，分析不同组织内氢离子的不同排列形态，形成磁敏感成像。
一般情况下，核磁共振是神经外科最常用的技术之一，应用于大脑病变患者，甚至是癫痫症患者。MRI可以检测到脑部的组织是否有任何的问题，比如肿瘤、出血、创伤、脑组织的畸形等。而且，清晰度更高，甚至可以通过谐波检测，观察到微小的损伤。CT会产生一些放射性物质，对于一些孕妇和即将受孕的女性来说，最好不要接触。而核磁共振成像则比较无放射性，因而更为保险。
