成人甲状腺功能低下可能会导致神经方面的疾病、消化方面的疾病、心血管方面的疾病、内分泌方面的疾病等，具体分析如下：
甲状腺功能低下一旦确诊，要及时治疗，否则会导致神经方面的疾病，引起嗜睡、昏迷、头晕、共济失调等，还可引起消化方面的疾病，出现消化不良、麻痹性肠梗阻、营养不良性贫血、厌食等情况，还可引起心血管方面的疾病，表现为心绞痛、心动过缓等，还可引起内分泌方面的疾病，表现为女性月经过多、不孕、男性阳痿等。严重的甚至会出现心肾功能衰竭，甚至死亡。
先天性甲状腺功能低下是儿童期常见的智力障碍性疾病之一。
先天性甲状腺功能低下又称先天性甲减，又称呆小症，一般早期无明显症状，症状出现后可能已为时过晚。一旦出现症状将严重影响儿童智力发育，导致身材矮小、智力低下。若能在2个月内发现，及时治疗，可长期保持甲状腺功能正常，智力基本恢复正常。如果10个月后被发现并治疗，智商只有正常的80%左右。超过2岁后被发现的话，智力发育会下降。
甲状腺激素分泌减少或者体内代谢降低会导致甲状腺功能低下，要忌食生冷刺激性的食物，多吃维生素蛋白质高的食物，要做好保暖，养成每天排便的习惯，会影响其他器官的功能。
甲状腺功能减退可表现为畏寒、食欲减退、体重增加、便秘等代谢减退临床症状，女性可能出现月经失调。
甲状腺功能严重减退可导致肺及心脏浆膜腔积液、胸腔积液、心包积液、腹腔积液等。成人甲状腺功能减退可分为外周性和中枢性，其中外周性甲减常见于桥本氏甲状腺炎，可补充甲状腺激素治疗。中枢性甲减常合并其余内分泌系统疾病，需进一步鉴别诊断。
大部分先天性甲状腺功能低下不能治好。
先天性甲减的病因，75%是甲状腺发育不全，此外还包括甲状腺激素合成障碍、中枢性甲减。因此，先天性甲状腺功能减退症的大部分不能完全治愈，但也有新生儿能完全治愈短暂性甲减，所占比例不足10%。先天性甲状腺功能减退症患者经明确诊断后，应积极治疗，定期评估，评估是否为永久性甲减。首次甲状腺扫描提示甲状腺异常或缺损，诊断为永久性甲减，不能治愈。早期促甲状腺激素小于50mU/L，新生儿出手后甲状腺刺激激素不升高是，3岁时可试验性中止治疗，如果中止治疗后甲状腺刺激激素升高，则认为是永久性甲减。
有76%的人会有抑郁的表现，比如无助，往往先于身体的表现。
有些病人还会出现幻觉，幻想等心理疾病。在做完手术之后，还可能会导致患有抑郁症，如甲状腺炎、长期服用锂盐等。与此形成对照的是，约10%的忧郁症病人存在某种程度的低甲状腺激素，并且经常出现亚临床症状。无征兆的自体免疫性甲状腺炎，在接受锂盐疗法的病人和分娩病人中，都会出现轻度的甲减，这些都会使病人出现忧郁症。
