肝脏自身的合成增加以及肠道的吸收增加，肠道的吸收由胆道进入肠道，从食物当中摄取胆固醇。是由于自身遗传的背景会导致某些代谢、蛋白胆固醇代谢相关的一些基因发生突变，会导致低密度脂蛋白胆固醇的代谢或者清除发生障碍，也会使得低密度脂蛋白胆固醇偏高。
低密度胆固醇偏高的危害主要有，形成动脉粥样硬化性斑块，如果血液中低密度胆固醇偏高，将沉积于心脑等部位血管的动脉壁内，逐渐形成动脉粥样硬化性斑块，阻塞相应的血管，最后可以引起冠心病、脑卒中和外周动脉病等致死致残的严重性疾病。还有诱发脂肪肝，肝功能不全者，长期出现低密度脂蛋白偏高，就会诱发脂肪肝，病人出现肝肿大，食欲减退，肝区胀痛，转氨酶升高等。
低密度脂蛋白胆固醇偏低会使脂肪沉积于血管壁上，造成血管内皮损害，是动脉粥样硬化的危险因素之一，它的升高会增加冠心病、脑血管疾病、高血压等疾病的风险。所以低密度脂蛋白胆固醇偏低一些是好事。
低密度脂蛋白胆固醇高，这往往是由于高胆固醇高热量食物摄入太多，运动又太少导致的，高脂血症病人最安全特效没有副作用的治疗方式，就是要控制自己的饮食，忌烟酒，多清淡饮食，减少食用油，油炸食品，高胆固醇和高脂食品的摄入量，同时要坚持一定量的体育运动锻炼，很多高脂血症，血液粘稠病人可以不药而愈，不运动是肯定不行的。
显示低密度脂蛋白胆固醇偏低，低密度脂蛋白胆固醇浓度和冠心病的发病率有明显的正相关，也就是它的增高提示冠心病发病率也会出现升高。它的减低一般多见于贫血，营养不良或者是肝病等原因导致的。
一般没有任何危害，低密度脂蛋白胆固醇属于致动脉粥样硬化的危险因素，可以导致动脉粥样硬化的发生，比如可以导致冠心病、脑梗死的出现。越低的获益越大，不会因为低密度脂蛋白胆固醇偏低而造成出现危及生命的病情，所以有的时候甚至服用特殊的药物将低密度脂蛋白胆固醇控制在标准范围以下，可以更好地预防动脉硬化的出现。
