一般可以通过B超、症状等方式判断流产是否干净。
通过B超检查胎儿组织有没有被清除干净，是最安全，也最可靠的方式。根据临床表现，药物流产或者人流后的阴道流血会减少，半个多星期后就会完全消失，没有任何的不适。如不能排空，则会出现早期妊娠的情况，阴道会出现大量的持续性大出血，同时还会出现下腹下坠疼痛等情况。女性自身体质较差，抵抗力较差，会导致女性出现阴道感染、盆腔炎、子宫内膜炎等妇科疾病。
如果B超确定是宫内孕的话，最后一次药吃完后2小时有阴道流血和腹痛，在4到8小时就可以排出了。如果服药后2小时还不痛要加药物，用药后严密观察，失败要及时手术终止妊娠。
吃药流产第3天，胚胎才能排出，所以吃药第三天要到医院观察。个别对药物敏感的孕妇，没到第三天就流出胚胎组织，口服药物过程中没有到时间就出现腹痛、阴道流血及流出胚胎组织，要随时到医院就诊。
流产后的孕囊排泄时间取决于是哪种流产。
正常情况下，每个人的孕囊排泄的次数都不一样，有些人一两天就能排出孕囊，有些人可能要一星期左右才能排出孕囊。如果是药物性流产，通常在服用米索后2-4个小时内就能排出，最多24个小时就能排出孕囊。女性在孕囊排出完后要注意保持外阴部位的清洁，避免出现剧烈的运动，避免着凉。
药流后孕囊排出体外不一定表明是完全流产。
用药前严格筛选，包括询问病史，进行全身体检和妇科检查，作实验室检查，如尿妊娠试验，阴道清洁度，滴虫和霉菌，血常规和血型，必要时做B超检查。药流后孕囊排出体外不一定表明是完全流产，因为即使有白色的孕囊排出体外，但还是可能会残存少部分的胎盘组织，需要在半个月左右复查妇科经阴道的超声。
吃药流产约2天-3天，子宫腔内的胚囊即可排出，此时阴道出血较多，可有头晕、恶心、呕吐、乏力、腹痛等反应，而子宫中的蜕膜组织往往在2周左右才能慢慢排出，随后出血停止，这称为完全流产。
