一般比较早期的囊肿在其比较小的时候，可以通过局部制动、按摩的方法消除。当囊肿逐渐长大后可以先尝试用力按压挤破囊肿，可也以暂时消除，但是一般容易复发。如果囊肿生长部位不影响患者生活，也可以不做处理。
肝囊肿通常很少引起疼痛。疼痛不适仅在伴随细菌感染和炎症刺激时出现。它主要引起压迫性疼痛，如体积增大和血液循环不良，导致胸闷和胸痛。肝囊肿可以通过疏通或外科穿刺引流来治疗。
跑步不能治疗肝囊肿。但是跑步可以提高病人的身体免疫能力，从而可以抑制肝囊肿的增大，防止病人的肝囊肿出现恶化、癌变的情况。对于肝囊肿的病人是需要根据囊肿的病理来采取药物治疗、手术切除等方式进行治疗。
肝囊肿是否会生长是不可预测的。只能通过一次又一次的观察来判断。如果病人的囊肿没有生长，也没有给病人带来不适，那么就不需要治疗，继续观察是好的。如果有增长的迹象，那么就需要手术。必要时可以考虑局部切除肝脏组织。
肝囊肿可以适当少量饮酒。但是不宜过多，否则会加重肝脏的负担，可能会导致囊肿进一步的加重。肝囊肿依附在肝脏上会对肝脏的功能产生影响，肝脏的解毒和代谢功能受损，而酒精恰恰又需要通过肝脏代谢和解毒，酒精进入人体后，不仅会导致低密度脂肪蛋白合成减少，而且还会加重肝细胞发生变性和坏死。
