如果结石较大，可以通过，体外碎石或是手术治疗肾囊肿。平时多喝水，多运动，不要暴饮暴食，饮食以清淡为主，少吃高脂肪的食物，忌食油炸食物，动物脂肪及内脏，慎食蛋黄。手术后要多注意休息。
肾囊肿和肾结石两个疾病的治疗方式有一定的差别。肾结石可以吃一些药物来治疗，药物治疗效果不好的时候，也可以通过手术的方式来碎石，肾囊肿必须要通过手术的方式来治疗。
我认为主要取决于肾功能是否有所改变。如果囊肿的肾功能也发生了变化，要在彩色多普勒超声的定位下穿刺取囊肿。对于肾结石问题，它主要取决于结石的大小。如果小于电6公分，仍有可能将其排出。相反，我认为体外碎石术是普遍需要的。
不属于是肾结石的，但是有囊壁钙化现象就要注意了，因为有了钙化灶之后会演变成结石的，一般不需特殊处理，肾囊肿伴囊壁钙化灶可能是囊肿壁有钙质沉积造成，不需特殊治疗了，平时一定要多喝水。
肾结石肾囊肿囊内有钙化是肾钙化灶，钙沉积在骨骼以外称钙化灶，是疾病愈合的表现，不排除是肾结核，结石等导致的，进一步检查确诊，主要是由于肾以前发生过慢性炎症，炎症机化，钙化，这是一系列变化，如果钙化灶不大，没什么问题的，无需特殊处理，如果有肾结石按照肾结石的治疗原则进行治疗。
针对肾结石，肾囊肿的病人，具体怎么办还是要根据具体结石的病情以及囊肿的病情来决定具体的治疗方法。
要给患者做彩超，CT及其他检查以明确肾结石具体情况和肾囊肿大小及其他病情。在这些方面都要根据患者实际的病情进行具体的分析，这样才能够制定出相应的方案。通常情况下，肾结石如体积较小，梗阻轻者可采用某些药物处理，许多患者都能以保守方式排出结石。如结石的体积较大，也许有必要用手术方法清除肾结石。在临床中通常会选择肾穿刺取石和经皮肾镜取石术这两种方式。肾囊肿通常都属于良性疾病，如体积小患者无症状，然后就能定期观察了，若囊肿超过四厘米，或认为囊肿可能恶变，则应积极手术。
