一般来说，肝囊肿并不需要口服药物进行治疗。
除肝囊肿出现感染需要静脉用药的特殊情况外，通常情况下，针对较小的肝囊肿，仅保持定期彩超随访观察即可；而针对较大的肝囊肿，通常采取腹腔镜下肝囊肿开窗引流术或者局限性的肝段切除术等手术治疗。
肝囊肿患者平时应该适当运动，比如慢跑、游泳等，早睡早起，注意多休息，适量吃新鲜的水果和蔬菜，并清淡饮食，有利于身体健康。
肝囊肿吃药、打针是不会消除的，当囊肿长得过大可以行手术治疗。所以肝囊肿不需要特殊处理的，应当定期复查，观察囊肿变化情况。当囊肿增大到一定程度时，可以出现一些临床症状，比如上腹部的隐痛不适。
临床上所见的肝囊肿大部分是先天性的囊肿，通过口服药物是无法消除的，大部分的也不需要临床处理，少部分需要处理的，也主要是通过腹腔镜下肝囊肿开窗引流，如果不能耐受手术，可以考虑通过彩超并下肝脓肿穿刺引流，并向腔内注射无水乙醇。
很可能患有肝囊肿并感染，肝囊肿很少伴有感染。如果有感染，必须排除。尽快到当地三级甲等公立医院、肝胆外科门诊和专家门诊进一步治疗，并尽快做腹部ct检查，包括平片扫描和增强扫描。然后静脉注射敏感抗生素，抗感染治疗两周以上。
一般比较早期的囊肿在其比较小的时候，可以通过局部制动、按摩的方法消除。当囊肿逐渐长大后可以先尝试用力按压挤破囊肿，可也以暂时消除，但是一般容易复发。如果囊肿生长部位不影响患者生活，也可以不做处理。
