阴壁囊肿手术是需要进行麻醉的，所以手术的时候不会太疼，但是手术后有一段时间会疼痛的，需要两周左右的时间，伤口就会恢复的，手术后，注意进行换药处理，要预防伤口感染。
这个是要区分是什么囊肿了，但是不论是哪种囊肿，如果疼痛的话，都是不好的，都是需要及时就医的。就卵巢囊肿来说，如果有疼痛不排除有增大的可能性，如果超过5cm就需要手术治疗。同样的小于5cm也是要及时治疗的，以防囊肿的继续增大。
肝囊肿通常很少引起疼痛。疼痛不适仅在伴随细菌感染和炎症刺激时出现。它主要引起压迫性疼痛，如体积增大和血液循环不良，导致胸闷和胸痛。肝囊肿可以通过疏通或外科穿刺引流来治疗。
乳腺囊肿多见于乳腺纤维瘤，多数是没有不适症状的，需要去医院乳腺科就诊，先做一个乳腺的彩超检查明确一下，如果是乳腺纤维瘤，可以口服药物控制，对于症状严重的也可以考虑手术切除。
大多数时候病人是感觉不到疼痛的，因为微创巧克力囊肿手术，大多数的时候都是用全身麻醉，手术过程中病人不会感受到疼痛，但是在手术结束后，病人会感受到伤口上的疼痛。在恢复期间，病人可以配合医院的药物，减少疼痛。
