高密度脂蛋白被认为可以降低心脏病的风险，对心血管系统具有重要的保护作用，具有强大的抗动脉粥样硬化的作用。通常认为不能溶解于血液的胆固醇必须依附在脂蛋白上，才能从周边组织进入肝脏进而被分解代谢、排出体外，只有高密度脂蛋白才能完成这种运输任务。高密度脂蛋白是对人体较好的胆固醇，对心血管系统有较好的作用，因此高密度脂蛋白偏高是好现象。
高密度脂蛋白起到抗动脉粥样硬化作用，它的降低是临床冠心病的危险因子之一，并可能促进动脉粥样硬化的发展。低密度脂蛋白是动脉粥样硬化的危险因素之一，被认为是致动脉粥样硬化的因子。
高密度脂蛋白胆固醇升高是好的。它是所有血脂项目当中唯一一个，升高具有保护性意义的血脂。高密度脂蛋白具有抗动脉粥样硬化的作用，因为高密度脂蛋白可以将泡沫细胞中的胆固醇带出来，转运给肝脏进行分解代谢。
高密度脂蛋白偏高的原因是慢性肝炎、脂肪肝、淤积性肝硬化，也可以见于原发性高密度脂蛋白血症。出现高密度脂蛋白升高，也可以见于一些生理性表现，比如是由于过度疲劳透支，饮食中含有大量的雌激素、服用避孕药和维生素E、大量饮酒等情况。
高密度脂蛋白胆固醇是血脂化验当中的一项，而且它是脂蛋白当中唯一一个越高越好的化验指标，越高就越不容易发生动脉粥样硬化性疾病，偏高意思就是指它高于高密度脂蛋白胆固醇的正常范围。
高密度脂蛋白胆固醇偏低一般是高脂血症，高密度脂蛋白是血液中密度最高，颗粒最小的一种脂蛋白，高密度脂蛋白胆固醇与心脑血管疾病的发病率呈负相关，被认为是一种抗高脂血症，抗冠心病和动脉粥样硬化的保护因子，高密度脂蛋白越高越好。
