随着肿块的进展，可导致贲门管腔狭窄，导致吞咽困难，胸骨后疼痛等。肿块长到一定程度，会导致肿瘤的坏死、溃疡，导致消化道出血，是上消化道出血的典型表现，有呕血、黑便等。由于进食困难和消化道出血，可导致患者营养障碍，表现为消瘦、贫血等。晚期病变可变为转移的症状，如肝肺的转移灶，锁骨上淋巴结肿大等。
贲门癌晚期随着病情的进展，临床表现多种多样。由于贲门属于胃入口，该区域发生病变，可以引起梗阻，严重时出现不能进食、进水，在临床上贲门癌晚期多以消耗为主要表现，出现恶病质，常处于饥饿的状态。肿瘤穿透可引起穿孔、破溃引起大出血，甚至死亡。
贲门肿瘤的早期症状为：出血：食管癌、贲门癌有时也会呕血或便血，贲门癌的肿瘤可浸润大血管而发生致命性大出血。疼痛：胸骨后或背部肩胛区持续性钝痛，表示贲门癌的癌外侵，引起食管周围纵隔炎，贲门癌引起的疼痛也可以发生在上腹部，应注意贲门癌的肿瘤有穿孔的可能。
早期贲门癌是没有什么明显的症状。即使有一些症状也和普通的上消化道疾病，比如胃炎、胃溃疡、反流性食管炎的表现，比如腹胀、隐痛、嗳气等没有明显的区别。中晚期的贲门癌，临床症状和食管癌比较相似，典型的表现就是进行性吞咽困难。
贲门癌的主要症状是出血，可以引起黑便或者是呕血，另外可以导致疼痛症状，特别是出现在胸骨的后方，以及肩胛骨位置出现长时间的钝痛，除此之外，还影响到进食，导致吞咽困难，体重下降。
