输尿管结石治疗方法要据病人的具体情况而决定。若结石体积较小、存在时间的短，输尿管及膀胱无梗阻、采取保守治疗便可将结石排出，如药物治疗、多饮水及适当运动等。而需手术治疗输尿管结石的适应症如下：输尿管、尿道或膀胱存在畸形或狭窄，即便结石体积小也需要手术治疗。
输尿管结石疼痛是由于结石梗阻导致的，而输尿管结石疼痛的位置是由于结石的位置而决定的，不同的位置就可能造成不同的疼痛部位。输尿管结石梗阻于上段输尿管时，产生的疼痛主要位于后腰部或两侧腹部处，并沿输尿管行径，放射至同侧睾丸或阴唇和大腿内侧。
及时的去医院做个肾脏彩超或者是尿路造影，有堵塞需要及时碎石或者手术取石治疗。输尿管结石肾积水，影响了新陈代谢，输尿管结石肾积水的治疗要根据结石大小、部位、数目、形状、一侧或两侧、有无尿流梗阻、伴有感染、肾功能受损程度。
中医治疗肾结石和输尿管结石效果不好，肾结石的形成是由于尿中晶体物质浓度升高，析出结晶并在局部生长、聚集的结果，结石活动会出现疼痛和血尿，中医中药有促进结石排出作用，常用于辅助治疗。
输尿管结石手术后，导流管在手术后一周就可以拔除，在患者的输尿管内也会放一个双接管，管需要患者出院带回家，一般在术后一个月，再到医院进行拔除。回家以后，体内有双接管，患者要少活动、勤排尿，避免双接管摩擦膀胱内壁引起疼痛和血尿。
在结石排出的过程中，可能会引起一侧的腰腹部疼痛，主要是小的结石在排除过程中引起输尿管痉挛而导致的疼痛。如果疼痛比较剧烈，可以用止痛药缓解。多摄取水分，促进排尿，有助于结石排出。
