在巴氏腺囊肿初期，可以服用一些抗感染的药物，比如头孢克肟分散片、头孢克肟咀嚼片等，可以配合甲硝唑进行抗感染。还可以配合局部坐浴，或者是服用一些清热解毒的中药来治疗。巴氏腺囊肿在服用药物的过程中，要注意观察，如果没有明显的改善，导致局部肿胀、疼痛、行走困难，甚至出现了不稳定的症状，这种情况下不能再服用药物。必须通过外科手术切开引流，否则会导致持续的疼痛，从而影响到工作和学习。
巴氏腺囊肿的治疗主要是根据病人，具体的建议可以到当地医院去检查一下。用药前要超声检查孕囊大小，排除宫外孕。具体的建议可以到当地医院去检查一下。用药前要超声检查孕囊大小，排除宫外孕。自身的情况来决定的，如果囊肿长期存在多年不变，需要定期观察，不需要治疗，如果囊肿出现逐渐长大，影响生活，或者出现反复感染，经常形成脓肿。可以进行巴氏腺囊肿造口术，或者是co2造口术。孕囊能逐渐排出，没有备孕计划，一定要使用安全措施，多次流产容易引起各种妇科炎症。
巴氏腺囊肿（亦称巴多林腺）又称前庭大腺囊肿，前庭大腺位于两侧大阴唇后部，腺体开口于小阴唇内侧近处女膜处。前庭大腺分泌液排出受阻而积聚于管腔，引起腺体囊性扩张，就会引起巴氏腺囊肿。主要症状为一侧阴唇较另一侧肿大，由于巴氏腺囊肿可以长期存在，多年不变，如果不妨碍日常生活，则可以定期观察，无需治疗。
巴氏腺囊肿复发了，注意积极的应用药进行治疗，同时要注意进一步检查了解是否有糖尿病以及其他疾病的原因导致的这种症状。平时生活中一定要注意卫生，防止细菌感染，从根本上阻断感染的来源，以免再次复发。
巴氏腺囊肿手术半个月到1个月后能同房。
患者有巴氏腺囊肿，可行巴氏腺囊肿手术进行切除，在手术之后应该休息半个月到1个月的时间，来促进宫颈黏膜的恢复，这样才可以正常同房，也能有效的预防局部炎症感染。具体同房的时间因人而异，患者必须要根据自身的情况来判断，一定要注意，如果阴道内有持续性黄色分泌物排出，是不可以同房的，患者应到医院就诊，进行宫腔镜、白带常规等检查，等各项指标恢复正常之后才可以同房。
患者做巴士腺囊肿手术一般是需要住院的，主要是因为在临床上术后需要给予换药，并且要每天外阴护理两次，预防局部出现感染的可能性。一般的患者在术后五天才可以拆线，如果伤口愈合良好，体温正常，没有其他不舒服才可以出院。建议患者可以选择做开窗手术，这样既保留了腺体的功能，临床上又达到了治愈的目的，可避免出现复发的可能。
