肾囊肿可以由很多原因引起，先天遗传因素是肾囊肿最常见的原因之一，基因突变也是引起肾囊肿的发病原因之一，各种中毒对肾脏的损伤，例如常见的毒物有农药、化学制剂、放射线、污染等都会引起肾囊肿。具体原因可以到医院进行检查。
肾囊肿是常见的一种囊性的肾脏疾病，在60岁以上的老人有50%的发生率。对于单纯性的肾囊肿，不会影响肾功能，也不需要进行特殊的治疗，因为没有任何的药物可以使囊肿消退。
单纯性肾囊肿是囊肿性肾病中常见的一种肾脏的良性病变。单纯性肾囊肿是最常见的肾脏囊性疾病之一，通常多为单侧单发，罕见单侧多发，双侧出现者罕见，此病多发生于成年人。由于其临床症状和体征不典型或缺乏特异性而容易误诊为肾肿瘤或其它疾病，延误诊断与治疗。一般无临床症状，偶尔出现血尿、腹痛等。单纯性肾囊肿可造成泌尿系统损害，但通常不影响肾功能。
肾部囊肿是在肾脏部位形成的，不与外界相连通的囊性病变。有多种，单纯性囊肿，多囊肾，肾盂囊肿。肾囊肿形成原因有很多，有的人是先天就有肾囊肿，有的则是后天形成的，后天的基因突变，后天的细菌感染都有可能形成肾囊肿。
肾囊肿通常海绵肾无需进行治疗，多囊肾会演变为尿毒症，无较好的治疗方法。如果出现多发囊肿或普通囊肿，在排除肾癌的前提下，如果囊肿超过5cm，可以进行手术治疗，比如使用腹腔镜进行治疗，不会复发，预后较好，如果囊肿小于5cm，做手术可能会导致出血，不进行手术治疗。
